-
ລໍາດັບ Metagenomic -NGS
ເມຕາເຈນໂນມໝາຍເຖິງການສະສົມຂອງພັນທຸກໍາທັງໝົດຂອງຊຸມຊົນປະສົມຂອງສິ່ງມີຊີວິດເຊັ່ນ: ເມຕາgenome ສິ່ງແວດລ້ອມ, metagenome ຂອງມະນຸດ, ແລະອື່ນໆ. ມັນມີພັນທຸກໍາຂອງຈຸລິນຊີທີ່ປູກຝັງໄດ້ ແລະບໍ່ສາມາດປູກຝັງໄດ້.ການຈັດລໍາດັບ Metagenomic ແມ່ນເຄື່ອງມືໂມເລກຸນທີ່ໃຊ້ໃນການວິເຄາະວັດສະດຸພັນທຸກໍາປະສົມທີ່ສະກັດມາຈາກຕົວຢ່າງສິ່ງແວດລ້ອມ, ເຊິ່ງໃຫ້ຂໍ້ມູນລະອຽດກ່ຽວກັບຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຊະນິດພັນແລະຄວາມອຸດົມສົມບູນ, ໂຄງສ້າງປະຊາກອນ, ຄວາມສໍາພັນທາງ phylogenetic, ພັນທຸ ກຳ ທີ່ມີປະໂຫຍດແລະເຄືອຂ່າຍຄວາມສໍາພັນກັບປັດໃຈສິ່ງແວດລ້ອມ.
ເວທີ:ເວທີ Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics ເປັນເຄື່ອງມືໂມເລກຸນທີ່ໃຊ້ໃນການວິເຄາະວັດສະດຸພັນທຸກໍາປະສົມທີ່ສະກັດມາຈາກຕົວຢ່າງສິ່ງແວດລ້ອມ, ເຊິ່ງໃຫ້ຂໍ້ມູນລະອຽດກ່ຽວກັບຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຊະນິດພັນແລະຄວາມອຸດົມສົມບູນ, ໂຄງສ້າງປະຊາກອນ, ຄວາມສໍາພັນທາງ phylogenetic, genes ທີ່ເປັນປະໂຫຍດແລະເຄືອຂ່າຍຄວາມສໍາພັນກັບປັດໃຈສິ່ງແວດລ້ອມ, ແລະອື່ນໆ. ການສຶກສາ metagenomic.ການປະຕິບັດທີ່ໂດດເດັ່ນຂອງມັນຢູ່ໃນຄວາມຍາວທີ່ອ່ານສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນການປັບປຸງການວິເຄາະ metagenomic ລົງ, ໂດຍສະເພາະແມ່ນການປະກອບ metagenome.ການໄດ້ຮັບຜົນປະໂຫຍດຂອງການອ່ານຄວາມຍາວ, ການສຶກສາ Metanomic ທີ່ອີງໃສ່ Nanopore ແມ່ນສາມາດບັນລຸການປະກອບຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງຫຼາຍເມື່ອປຽບທຽບກັບ metagenomics ປືນ.ມັນໄດ້ຖືກຈັດພີມມາວ່າ metagenomics ທີ່ອີງໃສ່ Nanopore ສົບຜົນສໍາເລັດສ້າງ genomes ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍທີ່ສົມບູນແລະປິດຈາກ microbiomes (Moss, EL, et. al.ຊີວະພາບທໍາມະຊາດ, 2020)
ເວທີ:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
ໜ່ວຍຍ່ອຍໃນ 16S ແລະ 18S rRNA ທີ່ມີທັງພາກພື້ນທີ່ມີການອະນຸລັກສູງ ແລະ hyper-variable ແມ່ນລາຍນິ້ວມືໂມເລກຸນທີ່ສົມບູນແບບສໍາລັບການກໍານົດສິ່ງມີຊີວິດ prokaryotic ແລະ eukaryotic.ການໃຊ້ປະໂຍດຈາກການຈັດລໍາດັບ, amplicons ເຫຼົ່ານີ້ສາມາດຖືກກໍາຫນົດເປົ້າຫມາຍໂດຍອີງໃສ່ພາກສ່ວນທີ່ອະນຸລັກແລະພາກພື້ນ hyper-variable ສາມາດມີລັກສະນະຢ່າງເຕັມສ່ວນສໍາລັບການກໍານົດຕົວຂອງຈຸລິນຊີທີ່ປະກອບສ່ວນເຂົ້າໃນການສຶກສາທີ່ກວມເອົາການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີ, ການຈັດປະເພດ, phylogeny, ແລະອື່ນໆ. ໂມເລກຸນດຽວໃນເວລາຈິງ (SMRT ) ການຈັດລໍາດັບຂອງແພລະຕະຟອມ PacBio ຊ່ວຍໃຫ້ໄດ້ຮັບການອ່ານຍາວທີ່ຖືກຕ້ອງສູງ, ເຊິ່ງສາມາດກວມເອົາ amplicons ທີ່ມີຄວາມຍາວເຕັມ (ປະມານ 1.5 Kb).ທັດສະນະທີ່ກວ້າງຂວາງຂອງພາກສະຫນາມພັນທຸກໍາໄດ້ປັບປຸງການແກ້ໄຂຢ່າງຫຼວງຫຼາຍໃນຄໍາບັນຍາຍຂອງຊະນິດພັນໃນເຊື້ອແບັກທີເຣັຍຫຼືຊຸມຊົນເຊື້ອເຫັດ.
ເວທີ:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing ມີຈຸດປະສົງເພື່ອເປີດເຜີຍ phylogeny, taxonomy, ແລະຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງຊະນິດພັນໃນຊຸມຊົນຈຸລິນຊີໂດຍການສືບສວນຜະລິດຕະພັນ PCR ຂອງເຄື່ອງໝາຍພັນທຸກໍາຂອງຄົວເຮືອນທີ່ມີທັງສ່ວນທີ່ມີການປ່ຽນແປງຫຼາຍ ແລະ hypervariable.ການແນະນໍາຂອງລາຍນິ້ວມືໂມເລກຸນທີ່ສົມບູນແບບເຫຼົ່ານີ້ໂດຍ Woeses et al,(1977) ເສີມສ້າງໂປຣໄຟລ໌ microbiome ທີ່ບໍ່ມີການໂດດດ່ຽວ.ການຈັດລໍາດັບຂອງ 16S (ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍ), 18S (ເຊື້ອເຫັດ) ແລະ spacer transcribed ພາຍໃນ (ITS, ເຊື້ອເຫັດ) ອະນຸຍາດໃຫ້ກໍານົດທັງສອງຊະນິດທີ່ອຸດົມສົມບູນເຊັ່ນດຽວກັນກັບຊະນິດທີ່ຫາຍາກແລະບໍ່ລະບຸ.ເທກໂນໂລຍີນີ້ໄດ້ກາຍເປັນເຄື່ອງມືທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງແລະສໍາຄັນໃນການກໍານົດອົງປະກອບຂອງຈຸລິນຊີທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃນສະພາບແວດລ້ອມຕ່າງໆ, ເຊັ່ນ: ປາກຂອງມະນຸດ, ລໍາໄສ້, ອາຈົມ, ແລະອື່ນໆ.
ເວທີ:ເວທີ Illumina NovaSeq
-
ການຈັດລຳດັບເຊື້ອແບັກທີເຣຍ ແລະເຊື້ອເຫັດທັງໝົດຄືນໃໝ່
ການຈັດລໍາດັບເຊື້ອແບັກທີເຣັຍແລະເຊື້ອເຫັດທັງຫມົດເປັນເຄື່ອງມືທີ່ສໍາຄັນເພື່ອເຮັດສໍາເລັດ genomes ຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍແລະເຊື້ອເຫັດທີ່ຮູ້ຈັກ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບການປຽບທຽບ genomes ຫຼາຍຫຼືແຜນທີ່ genomes ຂອງສິ່ງມີຊີວິດໃຫມ່.ມັນເປັນສິ່ງ ສຳ ຄັນຫຼາຍທີ່ຈະຈັດລຽງລຳດັບພັນທຸກຳຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍ ແລະເຊື້ອເຫັດທັງໝົດ ເພື່ອສ້າງ genomes ອ້າງອີງທີ່ຖືກຕ້ອງ, ການກວດຫາຈຸລິນຊີ ແລະ ການສຶກສາ genome ປຽບທຽບອື່ນໆ.
ເວທີ: Illumina NovaSeq Platform
-
ການຈັດລໍາດັບ Metatranscriptome
ການຈັດລໍາດັບ Metatranscriptome ລະບຸການສະແດງອອກຂອງເຊື້ອຈຸລິນຊີ (ທັງ eukaryotes ແລະ prokaryotes) ພາຍໃນສະພາບແວດລ້ອມທໍາມະຊາດ (ເຊັ່ນດິນ, ນ້ໍາ, ທະເລ, ອາຈົມ, ແລະລໍາໄສ້). ຂອງຊະນິດພັນ, ການວິເຄາະຄວາມອຸດົມສົມບູນທີ່ເປັນປະໂຫຍດຂອງພັນທຸກໍາທີ່ສະແດງອອກທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ແລະອື່ນໆ.
ເວທີ: Illumina NovaSeq Platform
-
ພັນທຸ ກຳ ເຊື້ອເຫັດ
Biomarker Technologies ໃຫ້ການສໍາຫຼວດ genome, genome ອັນດີງາມແລະ pene-complete genome ຂອງ fungal ຂຶ້ນກັບເປົ້າຫມາຍການຄົ້ນຄວ້າສະເພາະ.ການຈັດລໍາດັບ genome, ການປະກອບແລະຄໍາບັນຍາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດແມ່ນສາມາດບັນລຸໄດ້ໂດຍການລວມເອົາລໍາດັບການຜະລິດຕໍ່ໄປ + ລໍາດັບການຜະລິດທີສາມເພື່ອບັນລຸການປະກອບ genome ລະດັບສູງ.ເທກໂນໂລຍີ Hi-C ຍັງສາມາດຖືກຈ້າງງານເພື່ອອໍານວຍຄວາມສະດວກໃນການປະກອບພັນທຸກໍາໃນລະດັບໂຄໂມໂຊມ.
ເວທີ:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
ເວທີ Illumina NovaSeq
-
ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍຄົບຖ້ວນສົມບູນ
Biomarker Technologies ໃຫ້ບໍລິການຈັດລໍາດັບໃນການກໍ່ສ້າງ genome ຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍທີ່ສົມບູນໂດຍບໍ່ມີຊ່ອງຫວ່າງ.ຂະບວນການເຮັດວຽກຕົ້ນຕໍຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍການກໍ່ສ້າງ genome ສໍາເລັດປະກອບມີການຈັດລໍາດັບການຜະລິດທີສາມ, ການປະກອບ, ຄໍາອະທິບາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດແລະການວິເຄາະ bioinformatic ກ້າວຫນ້າເພື່ອບັນລຸເປົ້າຫມາຍການຄົ້ນຄວ້າສະເພາະ.ການສ້າງໂປຣໄຟລຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣັຍທີ່ກວ້າງຂວາງກວ່າ ຊ່ວຍໃຫ້ການເປີດເຜີຍກົນໄກພື້ນຖານທີ່ຕິດພັນກັບຂະບວນການທາງຊີວະວິທະຍາຂອງພວກມັນ, ເຊິ່ງຍັງສາມາດສະໜອງຂໍ້ມູນອ້າງອີງທີ່ມີຄຸນຄ່າສໍາລັບການຄົ້ນຄວ້າກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາໃນຊະນິດ eukaryotic ທີ່ສູງກວ່າ.
ເວທີ:ເວທີ Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
