ການຈັດລຳດັບ Amplicon (16S/18S/ITS)

ການຈັດລຳດັບ Amplicon (16S/18S/ITS) ດ້ວຍ Illumina ແມ່ນວິທີການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີໂດຍການລະບຸໂປຣໄຟລ໌ຈຸລິນຊີຕາມລຳດັບຂອງມັນ ແລະ ຈາກນັ້ນພະຍາຍາມຖອດລະຫັດຄວາມອຸດົມສົມບູນ ແລະ ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຊຸມຊົນພາຍໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ ແລະ ລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ. ທໍ່ສົ່ງ BMKCloud Amplicon (NGS) ຊ່ວຍໃຫ້ການວິເຄາະ 16S, 18S, ITS ແລະ ຍີນທີ່ເຮັດວຽກຫຼາຍຊະນິດ. ມັນເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍການຕັດແຕ່ງການອ່ານ, ການປະກອບການອ່ານແບບຄູ່ ແລະ ການປະເມີນຄຸນນະພາບ, ຕາມດ້ວຍການຈັດກຸ່ມຂອງການອ່ານທີ່ຄ້າຍຄືກັນເພື່ອສ້າງໜ່ວຍງານ Operational Taxonomic Units (OTUs) ທີ່ໃຊ້ໃນຫົກພາກສ່ວນການວິເຄາະທີ່ແຕກຕ່າງກັນ. ຄຳອະທິບາຍດ້ານ taxonomic ໃຫ້ຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບຄວາມອຸດົມສົມບູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ ແລະ ອົງປະກອບຂອງແຕ່ລະຕົວຢ່າງ, ໃນຂະນະທີ່ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ alpha ແລະ beta ສຸມໃສ່ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີພາຍໃນ ແລະ ລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ, ຕາມລຳດັບ. ການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງລະຫວ່າງກຸ່ມພົບ OTUs ທີ່ແຕກຕ່າງກັນໂດຍໃຊ້ທັງການທົດສອບ parametric ແລະ non-parametric, ໃນຂະນະທີ່ການວິເຄາະ correlation ເຊື່ອມໂຍງຄວາມແຕກຕ່າງເຫຼົ່ານີ້ກັບປັດໄຈສິ່ງແວດລ້ອມ. ສຸດທ້າຍ, ຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງຍີນທີ່ເຮັດວຽກແມ່ນຄາດຄະເນໂດຍອີງໃສ່ຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງຍີນ marker, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບໜ້າທີ່ ແລະ ນິເວດວິທະຍາໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ.