ການຈັດລຳດັບ Amplicon (16S/18S/ITS)

ການຈັດລໍາດັບ Amplicon (16S/18S/ITS) ກັບ Illumina ແມ່ນວິທີການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີໂດຍການລະບຸໂປຣໄຟລ໌ຈຸລິນຊີຕາມລໍາດັບຂອງພວກມັນ ແລະ ຈາກນັ້ນພະຍາຍາມຖອດລະຫັດຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງຊຸມຊົນ ແລະ ຄວາມຫຼາກຫຼາຍພາຍໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ ແລະລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ. ທໍ່ BMKCloud Amplicon (NGS) ອະນຸຍາດໃຫ້ວິເຄາະ 16S, 18S, ITS ແລະພັນທຸກໍາທີ່ເປັນປະໂຫຍດ. ມັນເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍການຕັດການອ່ານ, ການປະກອບການອ່ານແບບຄູ່ແລະການປະເມີນຄຸນນະພາບ, ຕິດຕາມດ້ວຍການຈັດກຸ່ມການອ່ານທີ່ຄ້າຍຄືກັນເພື່ອສ້າງຫນ່ວຍງານ Taxonomic (OTU) ທີ່ໃຊ້ໃນຫົກພາກສ່ວນການວິເຄາະທີ່ແຕກຕ່າງກັນ. ຄໍາອະທິບາຍກ່ຽວກັບ taxonomic ໃຫ້ຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບຄວາມອຸດົມສົມບູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງແລະອົງປະກອບຂອງແຕ່ລະຕົວຢ່າງ, ໃນຂະນະທີ່ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ alpha ແລະ beta ສຸມໃສ່ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີພາຍໃນແລະລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ, ຕາມລໍາດັບ. ການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງລະຫວ່າງກຸ່ມພົບວ່າ OTUs ແຕກຕ່າງກັນໂດຍນໍາໃຊ້ການທົດສອບ parametric ແລະ non parametric, ໃນຂະນະທີ່ການວິເຄາະຄວາມກ່ຽວຂ້ອງກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມແຕກຕ່າງເຫຼົ່ານີ້ກັບປັດໃຈສິ່ງແວດລ້ອມ. ສຸດທ້າຍ, ຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງ gene ທີ່ເປັນປະໂຫຍດແມ່ນຄາດຄະເນໂດຍອີງໃສ່ຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງ gene, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບຫນ້າທີ່ແລະລະບົບນິເວດໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ.