●ການກະກຽມຫໍສະຫມຸດສາມາດເປັນມາດຕະຖານຫຼື PCR ຟຣີ
●ມີຢູ່ໃນ 4 ເວທີທີ່ຕັ້ງຄ້າຍ: Illumina Novaseq, MGI T7, Nanepore Promethethion P48, ຫຼື Pacbio Revio.
●ການວິເຄາະດ້ານຊີວະວິທະຍາ
●ບັນທຶກການອະນຸມັດແລະການພິມເຜີຍແຜ່ຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ປະສົບການທີ່ສະສົມໃນລໍາດັບ genome ສໍາລັບຫລາຍກວ່າ 1000 ຊະນິດໄດ້ສົ່ງຜົນໃຫ້ເກີດຜົນກະທົບທີ່ມີຜົນກະທົບຕໍ່ຫຼາຍກວ່າ 5000.
●ການວິເຄາະ bioinformatics ທີ່ສົມບູນແບບ: ລວມທັງການໂທຫາການໂທຫາການປ່ຽນແປງແລະການຊອກຫາທີ່ທັນສະໄຫມ.
●ສະຫນັບສະຫນູນຫລັງການຂາຍ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍເກີນໄປທີ່ໂຄງການສໍາເລັດດ້ວຍໄລຍະການບໍລິການຫລັງການຂາຍໃນເວລາ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການແກ້ໄຂບັນຫາ, ການຊ່ວຍເຫຼືອ, ແລະ Q & A Sessions ເພື່ອແກ້ໄຂການສອບຖາມທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.
●ອະພິຈານ: ພວກເຮົາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນທີ່ຫຼາກຫຼາຍໃນການຈັດຕັ້ງພັນທຸກໍາທີ່ມີການປ່ຽນແປງທີ່ມີການປ່ຽນແປງແລະປະຕິບັດການວິເຄາະການເພີ່ມຂື້ນທີ່ສອດຄ້ອງກັນ, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໃນໂຄງການຄົ້ນຄ້ວາຫຼາຍໂຄງການ.
ຕົວປ່ຽນແປງທີ່ຈະໄດ້ຮັບການກໍານົດ | ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ | ຄວາມເລິກທີ່ແນະນໍາ |
SNP ແລະ indel | Illumina Novase/ PE150 ຫຼື mgi t7 | 10X |
sv ແລະ cnv (ຖືກຕ້ອງຫນ້ອຍ) | 30X | |
sv ແລະ cnv (ຖືກຕ້ອງກວ່າ) | Nanepore prom p48 | 20x |
snaps, indels, sv ແລະ cnv | PACBIO REVIO | 10X |
ເນື້ອເຍື່ອຫຼືກົດທີ່ສັບສົນ | Illumina / MGI | Nanepore | Pacbio
| ||
viscera ສັດ | 0.5-1 g | ≥ 3.5 g
| ≥ 3.5 g
| ||
ກ້າມເນື້ອ | ≥ 5 g
| ≥ 5 g
| |||
ເລືອດ mammalian | 1.5 ມລ | ≥ 0.5 ml
| ≥ 5 ml
| ||
ເລືອດສັດປີກ / ເລືອດປາ | ≥ 0.1 ມລ
| ≥ 0.5 ml
| |||
ຈຸ້ມ»ໃບສົດ | 1-2 g | ≥ 2 g
| ≥ 5 g
| ||
ຈຸລັງວັດທະນະທໍາ |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
ແມງໄມ້ອ່ອນ / ສ່ວນບຸກຄົນ | 0.5-1 g | ≥ 1 g
| ≥ 3 g
| ||
dna ສະກັດ
| ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ: ≥ 1 NG / μL ຈໍານວນເງິນ: ≥ 30 Ng ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ
| ຄວາມດົ້ວ ຈໍານວນ
od260 / 280
od260 / 230
ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ
| ≥ 40 ng / μL 4 μg / Flow Cell / Sample
1.7-2.2
≥1.5 | ຄວາມດົ້ວ ຈໍານວນ
od260 / 280
od260 / 230
ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ | ≥ 50 NG / μL 10 μg / flow cell / ຕົວຢ່າງ
1.7-2.2
1.8-2.5 |
ການກະກຽມຫໍສະຫມຸດທີ່ບໍ່ເສຍຄ່າ PCR: Concentration≥ 40 NG / μL ຈໍານວນ 500 ng |
ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
ສະຖິຕິຄວາມສອດຄ່ອງກັບການອ້າງອີງ Genome - ການແຈກຢາຍຄວາມເລິກຂອງຄວາມເລິກ
SNP ໂທຫາໃນບັນດາຕົວຢ່າງຫຼາຍຕົວຢ່າງ
ການກໍານົດ ALDEL
ການແຈກຢາຍຕົວປ່ຽນແປງໃນທົ່ວ genome - ດິນຕອນ circos
ຄໍາບັນຍາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດຂອງພັນທຸກໍາທີ່ມີຕົວແປທີ່ລະບຸຕົວຕົນ - Gener
Chai, Q. et al. (2023) 'Glutatherese Ghtte19 ກໍານົດເມັດສີດອກໄມ້ໂດຍການຄວບຄຸມການສະສົມ anthocyanin ໃນຝ້າຍ, 21 (2), P. 433. DOI: 10.111111 / PBI.13965.
Cheng, H. et al. (2023) 'CHOVOSION-NEVE-NATE-SET BRASIOSME BRASILIENSISL ໃຫ້ບໍລິການໃຫມ່ແລະມີຄຸນຄ່າໃນການຊ່ວຍເຫຼືອ genomic-bietochnology, 21 (5), PP. 1058-1072. DOI: 10.1111 / PBI.11418.
Li, A et al. (2021) 'Genome OyuCarine Oyster ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໃນຜົນກະທົບດ້ານພູມອາກາດແລະການຈັດການຕະຫລາດຕະຫຼົກປີ 2021 4: 1, 4 (1), PP. 1-12. DOI: 10.1038 / s42003-021-02823-6.
Zeng, T. et al. (20221) ການວິເຄາະ genome ແລະ methylation ໃນໄກ່ຈີນໃນເວລາທີ່ໃຊ້ເວລາສະຫນອງຄວາມເຂົ້າໃຈໃນການອະນຸລັກສັດ, 5 (1), PP. 1-12. DOI: 10.1038 / S42003-022-03907-7.