条形ປ້າຍໂຄສະນາ - 03

ຜະລິດຕະພັນ

ພືດ / ສັດທັງຫມົດທີ່ມີເພດສໍາພັນທັງຫມົດ

Sequencts Genome ທັງຫມົດ (WGS), ເຊິ່ງເອີ້ນວ່າການຫາຍໃຈ, ຫມາຍເຖິງການລຽງລໍາດັບ genome ທັງຫມົດຂອງບຸກຄົນທີ່ແຕກຕ່າງກັນຂອງຊະນິດພັນທີ່ມີ Genome Genomes. ບົນພື້ນຖານນີ້, ຄວາມແຕກຕ່າງຂອງ Genomic ຂອງບຸກຄົນຫຼືປະຊາກອນສາມາດໄດ້ຮັບການກໍານົດເພີ່ມເຕີມ. WGS ຊ່ວຍໃຫ້ການກໍານົດ polyoromism nucleotide ດຽວ (SNP), ການລຶບ (Indel), ປ່ຽນແປງໂຄງສ້າງປ່ຽນແປງ (SV), ແລະສໍາເນົາການປ່ຽນແປງຂອງຕົວເລກ (CNV). SVS ປະກອບເປັນສ່ວນທີ່ໃຫຍ່ກວ່າຂອງຖານຕ່າງກັນກ່ວາ snips ແລະມີຜົນກະທົບທີ່ຍິ່ງໃຫຍ່ກວ່າເກົ່າ, ສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ສິ່ງມີຊີວິດທີ່ມີຜົນກະທົບຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ. ໃນຂະນະທີ່ການສອບຖາມທີ່ອ່ານສັ້ນມີປະສິດຕິຜົນໃນການກໍານົດ snaps ແລະ indels, ການປ່ຽນແປງທີ່ອ່ານຍາວຊ່ວຍໃຫ້ມີການກໍານົດທີ່ຊັດເຈນແລະການປ່ຽນແປງທີ່ສັບສົນ.


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະພາບ

ຜົນໄດ້ຮັບຕົວຢ່າງ

ສິ່ງພິມທີ່ໂດດເດັ່ນ

ຄຸນນະສົມບັດການບໍລິການ

●ການກະກຽມຫໍສະຫມຸດສາມາດເປັນມາດຕະຖານຫຼື PCR ຟຣີ

●ມີຢູ່ໃນ 4 ເວທີທີ່ຕັ້ງຄ້າຍ: Illumina Novaseq, MGI T7, Nanepore Promethethion P48, ຫຼື Pacbio Revio.

●ການວິເຄາະດ້ານຊີວະວິທະຍາ

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

ບັນທຶກການອະນຸມັດແລະການພິມເຜີຍແຜ່ຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ປະສົບການທີ່ສະສົມໃນລໍາດັບ genome ສໍາລັບຫລາຍກວ່າ 1000 ຊະນິດໄດ້ສົ່ງຜົນໃຫ້ເກີດຜົນກະທົບທີ່ມີຜົນກະທົບຕໍ່ຫຼາຍກວ່າ 5000.

ການວິເຄາະ bioinformatics ທີ່ສົມບູນແບບ: ລວມທັງການໂທຫາການໂທຫາການປ່ຽນແປງແລະການຊອກຫາທີ່ທັນສະໄຫມ.

●ສະຫນັບສະຫນູນຫລັງການຂາຍ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍເກີນໄປທີ່ໂຄງການສໍາເລັດດ້ວຍໄລຍະການບໍລິການຫລັງການຂາຍໃນເວລາ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການແກ້ໄຂບັນຫາ, ການຊ່ວຍເຫຼືອ, ແລະ Q & A Sessions ເພື່ອແກ້ໄຂການສອບຖາມທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.

ອະພິຈານ: ພວກເຮົາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນທີ່ຫຼາກຫຼາຍໃນການຈັດຕັ້ງພັນທຸກໍາທີ່ມີການປ່ຽນແປງທີ່ມີການປ່ຽນແປງແລະປະຕິບັດການວິເຄາະການເພີ່ມຂື້ນທີ່ສອດຄ້ອງກັນ, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໃນໂຄງການຄົ້ນຄ້ວາຫຼາຍໂຄງການ.

ຂໍ້ສະເພາະຂອງການບໍລິການ

ຕົວປ່ຽນແປງທີ່ຈະໄດ້ຮັບການກໍານົດ

ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ

ຄວາມເລິກທີ່ແນະນໍາ

SNP ແລະ indel

Illumina Novase/ PE150

ຫຼື mgi t7

10X

sv ແລະ cnv (ຖືກຕ້ອງຫນ້ອຍ)

30X

sv ແລະ cnv (ຖືກຕ້ອງກວ່າ)

Nanepore prom p48

20x

snaps, indels, sv ແລະ cnv

PACBIO REVIO

10X

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ

ເນື້ອເຍື່ອຫຼືກົດທີ່ສັບສົນ

Illumina / MGI

Nanepore

Pacbio

 

viscera ສັດ

0.5-1 g

≥ 3.5 g

 

≥ 3.5 g

 

ກ້າມເນື້ອ

≥ 5 g

 

≥ 5 g

 

ເລືອດ mammalian

1.5 ມລ

≥ 0.5 ml

 

≥ 5 ml

 

ເລືອດສັດປີກ / ເລືອດປາ

≥ 0.1 ມລ

 

≥ 0.5 ml

 

ຈຸ້ມ»ໃບສົດ

1-2 g

≥ 2 g

 

≥ 5 g

 

ຈຸລັງວັດທະນະທໍາ

 

≥ 1x107

 

≥ 1x108

 

ແມງໄມ້ອ່ອນ / ສ່ວນບຸກຄົນ

0.5-1 g

≥ 1 g

 

≥ 3 g

 

dna ສະກັດ

 

ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ: ≥ 1 NG / μL

ຈໍານວນເງິນ: ≥ 30 Ng

ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ

 

ຄວາມດົ້ວ

ຈໍານວນ

 

od260 / 280

 

od260 / 230

 

ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ

 

≥ 40 ng / μL

4 μg / Flow Cell / Sample

 

1.7-2.2

 

≥1.5

ຄວາມດົ້ວ

ຈໍານວນ

 

od260 / 280

 

od260 / 230

 

ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ

≥ 50 NG / μL

10 μg / flow cell / ຕົວຢ່າງ

 

1.7-2.2

 

1.8-2.5

ການກະກຽມຫໍສະຫມຸດທີ່ບໍ່ເສຍຄ່າ PCR:

Concentration≥ 40 NG / μL

ຈໍານວນ 500 ng

ກະແສການເຮັດວຽກບໍລິການ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການທົດລອງທົດລອງ

ການສະກັດເອົາ DNA

ການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ

ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ

ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ

ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

数据上传 -03

ການຈັດສົ່ງຂໍ້ມູນ


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • 流程图 7-02

    ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:

    • ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນດິບ
    • ສະຖິຕິຂອງຄວາມສອດຄ່ອງກັບການອ້າງອີງ Genome
    • ການກໍານົດຕົວປ່ຽນແປງ: SNP, ORDEL, SV ແລະ CNV
    • ຄໍາບັນຍາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດຂອງຕົວປ່ຽນແປງ

    ສະຖິຕິຄວາມສອດຄ່ອງກັບການອ້າງອີງ Genome - ການແຈກຢາຍຄວາມເລິກຂອງຄວາມເລິກ

     

    图片 26

     

    SNP ໂທຫາໃນບັນດາຕົວຢ່າງຫຼາຍຕົວຢ່າງ

     

    图片 27

     

    ການກໍານົດ ALDEL

     

    图片 28

     

    ການແຈກຢາຍຕົວປ່ຽນແປງໃນທົ່ວ genome - ດິນຕອນ circos

    图片 29

    ຄໍາບັນຍາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດຂອງພັນທຸກໍາທີ່ມີຕົວແປທີ່ລະບຸຕົວຕົນ - Gener

     

    图片 30

    Chai, Q. et al. (2023) 'Glutatherese Ghtte19 ກໍານົດເມັດສີດອກໄມ້ໂດຍການຄວບຄຸມການສະສົມ anthocyanin ໃນຝ້າຍ, 21 (2), P. 433. DOI: 10.111111 / PBI.13965.

    Cheng, H. et al. (2023) 'CHOVOSION-NEVE-NATE-SET BRASIOSME BRASILIENSISL ໃຫ້ບໍລິການໃຫມ່ແລະມີຄຸນຄ່າໃນການຊ່ວຍເຫຼືອ genomic-bietochnology, 21 (5), PP. 1058-1072. DOI: 10.1111 / PBI.11418.

    Li, A et al. (2021) 'Genome OyuCarine Oyster ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໃນຜົນກະທົບດ້ານພູມອາກາດແລະການຈັດການຕະຫລາດຕະຫຼົກປີ 2021 4: 1, 4 (1), PP. 1-12. DOI: 10.1038 / s42003-021-02823-6.

    Zeng, T. et al. (20221) ການວິເຄາະ genome ແລະ methylation ໃນໄກ່ຈີນໃນເວລາທີ່ໃຊ້ເວລາສະຫນອງຄວາມເຂົ້າໃຈໃນການອະນຸລັກສັດ, 5 (1), PP. 1-12. DOI: 10.1038 / S42003-022-03907-7.

    ໄດ້ຮັບໃບສະເຫນີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານຢູ່ທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານໄປໃຫ້ພວກເຮົາ: