ການວິເຄາະ Eukaryotic mRNA (ອີງໃສ່ການອ້າງອີງແລະທາງເລືອກ de novo ທີ່ມີຢູ່)
ທໍ່ນີ້ໃຊ້ຂໍ້ມູນ NGS RNA-Seq ເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນ ແລະຜະລິດຜົນໄດ້ຮັບຈາກການວິເຄາະທາງລຸ່ມຫຼາຍອັນລວມທັງແຕ່ບໍ່ຈຳກັດພຽງແຕ່: ການປະເມີນຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນຕາມລຳດັບ,de novoການຖອດຂໍ້ຄວາມຈາກເວັບໄຊທ໌, ການວິເຄາະການແຍກຕົວແປ, ການວິເຄາະການສະແດງອອກຄວາມແຕກຕ່າງ, ການອະທິບາຍຟັງຊັນ ແລະການວິເຄາະການເສີມສ້າງ.
ການວິເຄາະ RNA ທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດຍາວ
RNAs ທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດຍາວ (lncRNA) ແມ່ນຂໍ້ຄວາມຖອດຈາກສຽງທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດທີ່ມີຄວາມຍາວຫຼາຍກວ່າ 200 nt ແລະເປັນທີ່ຮູ້ຈັກທີ່ຈະມີບົດບາດໃນການຈັດຕັ້ງ chromatin ແລະລະບຽບການ. ເທັກໂນໂລຍີການຈັດລຳດັບທີ່ຜ່ານລະດັບສູງ ແລະ ຂໍ້ມູນຊີວະວິທະຍາໄດ້ໃຫ້ອຳນາດຄວາມເຂົ້າໃຈຂອງພວກເຮົາກ່ຽວກັບລຳດັບ lncRNA ແລະຂໍ້ມູນການຈັດຕຳແໜ່ງເພື່ອລະບຸ lncRNAs ທີ່ມີໜ້າທີ່ຄວບຄຸມທີ່ສຳຄັນ. ທໍ່ນີ້ສະຫນອງການວິເຄາະ lncRNA ນອກເຫນືອຈາກການວິເຄາະທີ່ໄດ້ກ່າວມາໃນທໍ່ການວິເຄາະ Eukaryotic mRNA.
ການຈັດລຳດັບ amplicon 16S/18S/ITS
ທໍ່ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີ Amplicon Sequencing ໄດ້ຖືກພັດທະນາໂດຍອີງໃສ່ປະສົບການຫຼາຍປີໃນການວິເຄາະໂຄງການຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີ. ທໍ່ດັ່ງກ່າວປະກອບດ້ວຍການວິເຄາະພື້ນຖານມາດຕະຖານ, ເຊິ່ງກວມເອົາເນື້ອໃນການວິເຄາະຕົ້ນຕໍຂອງການຄົ້ນຄວ້າຈຸລິນຊີໃນປະຈຸບັນແລະການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນ. ບົດລາຍງານການວິເຄາະແມ່ນອຸດົມສົມບູນແລະທີ່ສົມບູນແບບ, ມີທາງເລືອກທີ່ຈະປະຕິບັດການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນທີ່ຫຼາກຫຼາຍ. ນອກຈາກນັ້ນ, ຕົວຢ່າງແລະກຸ່ມສາມາດຖືກດັດແປງໃນການບິນສໍາລັບການປັບແຕ່ງແລະການຄວບຄຸມເພີ່ມເຕີມ.
ການວິເຄາະ Metagenomics Shotgun
ທໍ່ການວິເຄາະ Metagenomic Shotgun ໃຊ້ຂໍ້ມູນ NGS ຈາກວັດສະດຸພັນທຸກໍາປະສົມທີ່ສະກັດມາຈາກຕົວຢ່າງສິ່ງແວດລ້ອມ. ການວິເຄາະລວມໃຫ້ຂໍ້ມູນລະອຽດກ່ຽວກັບຄວາມຫຼາກຫຼາຍຊະນິດແລະອຸດົມສົມບູນ, ໂຄງປະກອບການຂອງປະຊາກອນ, ຄວາມສໍາພັນທາງດ້ານພະຍາດ, ພັນທຸກໍາທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ແລະເຄືອຂ່າຍການພົວພັນກັບປັດໄຈສິ່ງແວດລ້ອມ.
ການວິເຄາະຕົວແປ NGS-WGS
ການວິເຄາະຕົວແປຂອງ NGS-WGS ແມ່ນທໍ່ການກວດພົບຕົວແປແບບປະສົມປະສານທີ່ປະຕິບັດການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ, ການຈັດລໍາດັບ, ຄໍາບັນຍາຍ, ແລະການວິເຄາະການກາຍພັນຂອງພັນທຸກໍາ. ທໍ່ດັ່ງກ່າວປະຕິບັດຕາມການປະຕິບັດທີ່ດີທີ່ສຸດຂອງ GATK ສໍາລັບການກວດສອບ SNP ແລະ InDel ແລະໃຊ້ Manta ສໍາລັບການເອີ້ນຕົວແປໂຄງສ້າງ.
ການສຶກສາສະມາຄົມ Genome Wide (GWAS)
ທໍ່ GWAS ແມ່ນການວິເຄາະທາງລຸ່ມທີ່ເອົາໄຟລ໌ VCF ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໃນເມື່ອກ່ອນແລະຂໍ້ມູນ phenotype ທີ່ສອດຄ້ອງກັນສໍາລັບກຸ່ມຂອງບຸກຄົນເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນ. ການນໍາໃຊ້ວິທີການສະຖິຕິສະເພາະ, GWAS ມີຈຸດປະສົງເພື່ອເປີດເຜີຍການປ່ຽນແປງຂອງ genome-wide nucleotide ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມແຕກຕ່າງ phenotypic. ມັນມີບົດບາດສໍາຄັນໃນການສໍາຫຼວດພັນທຸກໍາທີ່ມີປະໂຫຍດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພະຍາດຂອງມະນຸດທີ່ສັບສົນແລະລັກສະນະທີ່ສັບສົນໃນພືດແລະສັດ.
ການວິເຄາະການແບ່ງແຍກເປັນຊຸດ (BSA)
ການວິເຄາະ BSA ກ່ຽວຂ້ອງກັບການລວມເອົາບຸກຄົນທີ່ມີລັກສະນະ phenotypic ຮ້າຍແຮງຈາກປະຊາກອນທີ່ແຍກກັນ. ໂດຍການປຽບທຽບຈຸດທີ່ແຕກຕ່າງລະຫວ່າງຕົວຢ່າງທີ່ລວມກັນ, ວິທີການນີ້ກໍານົດຕົວກໍານົດໂມເລກຸນທີ່ເຊື່ອມຕໍ່ຢ່າງໃກ້ຊິດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພັນທຸກໍາເປົ້າຫມາຍ. ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນແຜນທີ່ພັນທຸກໍາຂອງພືດແລະສັດ, ມັນເປັນເຄື່ອງມືທີ່ມີຄຸນຄ່າສໍາລັບການປັບປຸງພັນດ້ວຍເຄື່ອງຫມາຍ.
ການວິເຄາະວິວັດທະນາການພັນທຸກໍາ
ຂັ້ນຕອນການເຮັດວຽກການວິເຄາະພັນທຸກໍາວິວັດທະນາການໃຊ້ປະສົບການອັນກວ້າງຂວາງຂອງ BMKGENE ໃນໂຄງການວິວັດທະນາການທາງພັນທຸກໍາ ແລະປະກອບມີການກໍ່ສ້າງຕົ້ນໄມ້ phylogenetic, ການວິເຄາະຄວາມບໍ່ສົມດຸນຂອງການເຊື່ອມໂຍງ, ການປະເມີນຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງພັນທຸກໍາ, ການກໍານົດກວາດຄັດເລືອກ, ການວິເຄາະຍາດຕິພີ່ນ້ອງ, ການວິເຄາະອົງປະກອບຫຼັກ, ແລະລັກສະນະຂອງໂຄງສ້າງປະຊາກອນ.
