Metagenomics (NGS)

Shotgun metaagenomics ກັບ Illumina ເປັນເຄື່ອງມືທີ່ນິຍົມສໍາລັບການສຶກສາ microbiomes ໂດຍການຈັດລໍາດັບ DNA ໂດຍກົງຈາກຕົວຢ່າງທີ່ຊັບຊ້ອນ, ເຮັດໃຫ້ການສຶກສາຂອງຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ taxonomic ແລະຄວາມຫຼາກຫຼາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດ. ທໍ່ BMKCloud metagenomic (NGS) ເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບແລະການປະກອບ metagenome, ຈາກທີ່ genes ໄດ້ຖືກຄາດຄະເນແລະ clustered ເຂົ້າໄປໃນຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ບໍ່ຊ້ໍາກັນທີ່ມີຄໍາບັນຍາຍສໍາລັບຫນ້າທີ່ແລະ taxonomy ໂດຍໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນຫຼາຍ. ຂໍ້ມູນນີ້ຖືກໃຊ້ເພື່ອວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງອະນຸກອນໃນຕົວຢ່າງ (ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງອາລະຟາ) ແລະຄວາມຫຼາກຫຼາຍລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ (ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເບຕ້າ). ການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງລະຫວ່າງກຸ່ມພົບວ່າ OTUs ແລະຫນ້າທີ່ທາງຊີວະພາບແຕກຕ່າງກັນລະຫວ່າງສອງກຸ່ມໂດຍໃຊ້ການທົດສອບ parametric ແລະ non parametric, ໃນຂະນະທີ່ການວິເຄາະຄວາມກ່ຽວຂ້ອງກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມແຕກຕ່າງເຫຼົ່ານີ້ກັບປັດໃຈສິ່ງແວດລ້ອມ.