Bero-mapa
Matrix datu-fitxategia bero-mapa marrazteko erabiltzen da, eta matrizearen datuak iragazi, normalizatu eta multzokatu ditzake.Gehienbat lagin ezberdinen arteko gene-adierazpen-mailaren cluster azterketa egiteko erabiltzen da.
Gene Oharra
Gene-funtzioaren oharpena FASTA fitxategiko sekuentziak datu-base ezberdinekin mapatuz egiten da.
Gene Oharra
Tokiko Lerrokadura Bilatzeko oinarrizko tresna
CDS_UTR_Iragarpena
Tresna hau eskualde kodetzaileak (CDS) eta eskualde ez-kodetzaileak (UTR) iragartzeko diseinatuta dago transkripzio-sekuentzia jakinetan, proteina datu-base ezagunen eta ORF iragarpenaren aurka leherketak egitean oinarrituta.
Manhattan lursaila
Manhattan diagramak datu-puntu ugarirekin bistaratzeko aukera ematen du.Gehienetan erabiltzen da genoma osoko elkarteen ikasketetan (GWAS).
Zirkuak
CIRCOS diagramak SNP, InDeL, SV eta CNV banaketak genoman zuzenean aurkezteko aukera ematen du.
GO_Aberastea
TopGO funtzional aberasteko diseinatutako tresna da.TopGO-Bioconductor paketeak adierazpen diferentzialaren analisia, GO aberastearen analisia eta emaitzen bistaratzea ditu."Graph" izeneko irteera duen karpeta bat sortuko du, topGO_BP, topGO_CC eta topGO_MF-ren emaitzak dituena.
WGCNA
WGCNA oso erabilia den datu-meatzaritza metodo bat da, gene-adierazpen-moduluak ezagutzeko.Adierazpen datu-multzo ezberdinetarako aplikagarria da, besteak beste, mikroarray datuak eta hurrengo belaunaldiko sekuentziaziotik sortutako gene-adierazpen datuak barne.
InterProScan
InterPro proteinen sekuentziaren azterketa eta sailkapena
GO_KEGG_Aberastea
Tresna hau GO aberaste-histograma, KEGG aberaste-histograma eta KEGG aberaste-bidea sortzeko diseinatu da, emandako gene-multzoan eta dagokion oharpenean oinarrituta.