mRNA-seq (NGS) erreferentziazko genomarekin
RNA-seq bizitzaren eta laboreen zientzietan tresna estandarra da, genomaren eta proteomen arteko aldea txikitzen duena. Bere indarra transkripto berriak aurkitzean eta haien adierazpena saiakuntza bakarrean kuantifikatzean datza. Oso erabilia da transkriptomikako ikerketa konparatiboetarako, hainbat ezaugarri edo fenotiporekin lotutako geneak argituz, hala nola mutanteak basatiekin alderatuz edo geneen adierazpena baldintza espezifikoetan agerian utziz. BMKCloud mRNA(Reference) APP-ak adierazpen kuantifikazioa, adierazpen diferentzialaren analisia (DEG) eta sekuentzia-egituraren analisiak integratzen ditu mRNA-seq(NGS) bioinformatika-hodian eta antzeko softwarearen indarguneak batu ditu, erosotasuna eta erabilerraztasuna bermatuz. Erabiltzaileek beren RNA-seq datuak hodeira igo ditzakete, non Aplikazioak bioinformatika-analisi irtenbide integrala eta bakarra eskaintzen duen. Horrez gain, bezeroaren esperientzia lehenesten du, erabiltzaileen beharretara egokitutako eragiketa pertsonalizatuak eskainiz. Erabiltzaileek parametroak ezarri eta hodiaren misioa eurek bidali dezakete, txosten interaktiboa egiaztatu, datuak/diagramak ikusi eta datuen meatzaritza osatu, hala nola: helburuko geneen hautaketa, funtzioen multzokatzea, diagramak egitea, etab.
Plataforma:Illumina, MGI
Estrategia:RNA-Seq
Diseinua: Parekatua, datu garbiak.
Liburutegi mota:fr-haririk gabekoa, fr-lehen haria edo fr-bigarren haria
Irakurketa-luzera:150 bp
Fitxategi mota:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz edo *.fq.gz. Sistemak egingo duautomatikoki parekatu .fastq fitxategiak haien fitxategi-izenaren arabera,adibidez, *_1.fastq *._2.fastq-rekin parekatuta.
Lagin kopurua:Ez dago mugarik kopuruari dagokionezlaginen kopurua, baina analisi-denbora handituko da lagin kopurua ahalalaginak hazten dira.
Gomendatutako datu kopurua:6G lagin bakoitzeko
