mRNA eukariotoaren analisia (erreferentzian oinarritutako eta de novo aukerak eskuragarri)
Sekuentziazio-bide honek NGS RNA-Seq datuak erabiltzen ditu sarrera gisa eta hainbat analisietatik emaitzak sortzen ditu, besteak beste: sekuentziazio-datuen kalitatearen ebaluazioa,berrikitranskripzio gunearen anotazioa, aldagaien splicing-aren analisia, espresio diferentzialaren analisia, funtzioen anotazioa eta aberaste-analisia.
RNA luze ez-kodetzailearen analisia
RNA luze ez-kodetzaileak (lncRNA) 200 nt baino gehiagoko luzera duten transkripzio ez-kodetzaileak dira, eta kromatinaren antolaketan eta erregulazioan zeregina betetzen dutela ezagutzen da. Sekuentziazio-teknologia handiek eta bioinformatikak lncRNA sekuentzien eta kokapen-informazioaren ulermena ahalbidetu digute, funtzio erregulatzaile garrantzitsuak dituzten lncRNAk identifikatzeko. Hodi honek lncRNA analisia eskaintzen du, mRNA eukariotikoen analisi hodian aipatutako analisiez gain.
16S/18S/ITS anplikoi sekuentziazioa
Amplicon Sequencing mikrobioen aniztasunaren analisi-hodibidea mikrobioen aniztasunaren proiektuen analisian urteetako esperientzian oinarrituta garatu zen. Hodibideak oinarrizko analisi estandarizatua dauka, egungo ikerketa mikrobianoaren analisi-eduki nagusia eta analisi pertsonalizatua biltzen dituena. Analisi-txostena aberatsa eta osoa da, analisi pertsonalizatu anitza egiteko aukerarekin. Gainera, laginak eta taldeak berehala alda daitezke pertsonalizazio eta kontrol gehigarria lortzeko.
Eskopeta Metagenomikaren Analisia
Shotgun Metagenomic Analysis-en NGS datuak erabiltzen ditu ingurumen-laginetatik ateratako material genomiko mistoetatik. Barne hartzen diren analisiek informazio zehatza ematen dute espezieen aniztasunari eta ugaritasunari, populazioen egiturari, harreman filogenetikoei, gene funtzionalei eta ingurumen-faktoreekin duten korrelazio-sareei buruz.
NGS-WGS aldaeren analisia
NGS-WGS Aldaeren Analisia aldaeren detekzio-hodi integratu bat da, datuen kalitate-kontrola, sekuentzien lerrokatzea, anotazioa eta geneen mutazioen analisia egiten dituena. Hodiak GATKren jardunbide egokienak jarraitzen ditu SNP eta InDel detektatzeko eta Manta erabiltzen du egitura-aldaeren deialdirako.
Genoma Zabaleko Elkarte Azterketa (GWAS)
GWAS pipeline-a analisi bat da, aurretik sortutako VCF fitxategiak eta banakoen kohorte bati dagozkion fenotipo-datuak sarrera gisa hartzen dituena. Metodologia estatistiko espezifikoak erabiliz, GWAS-ek genoma osoko nukleotido-aldaerak aurkitzea du helburu, fenotipo-desberdintasunekin korrelazionatuta. Funtsezko zeregina du gizakien gaixotasun konplexuekin eta landareen eta animalien ezaugarri korapilatsuekin lotutako gene funtzionalak aztertzeko.
Banakako Bereizketa Analisia (BSA)
BSA analisiak populazio bereizi batetik muturreko ezaugarri fenotipikoak dituzten banakoak biltzea dakar. Laginen arteko lokus desberdinak alderatuz, ikuspegi honek gene helburuekin lotutako markatzaile molekular estuak identifikatzen ditu azkar. Landareen eta animalien mapaketa genetikoan oso erabilia, tresna baliotsua da markatzaileen bidezko hazkuntzarako.
Eboluzio Genetikaren Analisia
Eboluzio Genetikaren Analisiaren lan-fluxuak BMKGENEren eboluzio genetikoaren proiektuetan duen esperientzia zabala aprobetxatzen du eta honako hauek barne hartzen ditu: zuhaitz filogenetikoaren eraikuntza, lotura-desoreka aztertzea, dibertsitate genetikoaren ebaluazioa, hautaketa-selekzio bidezko identifikazioa, ahaidetasun-azterketa, osagai nagusien azterketa eta populazio-egituraren karakterizazioa.
