Složene i varijabilne alternativne izoforme u organizmima su važni genetski mehanizmi za regulaciju ekspresije gena i raznolikosti proteina.Točna identifikacija struktura transkripta temelj je za dubinsko proučavanje obrazaca regulacije ekspresije gena.Nanopore platforma za sekvenciranje uspješno je dovela transkriptomsku studiju na razinu izoforme.Ova platforma za analizu dizajnirana je za analizu RNA-Seq podataka generiranih na platformi Nanopore na temelju referentnog genoma, čime se postižu kvalitativne i kvantitativne analize na razini gena i razini transkripata.
