Bmkcloud prijaviti se

Proizvodi

DNK/RNA sekvenciranje - sekvence nanopora

DNK/RNA sekvenciranje - Nanopore Sequencer istaknuta slika

ONT sekvenciranje je jedinstvena tehnologija sekvenciranja električnog signala u stvarnom vremenu u stvarnom vremenu koja se temelji na nanoporama, princip sekvenciranja svake platforme je isti. Dvolančana DNA/RNA vezati će se na nanoporozni protein ugrađen u biofilm i odmotavanje pod olovom motoričkog proteina, pod djelovanjem naponske razlike s obje strane biofilma, nizovi DNA/RNA prolaze kroz protein nanopora na nanoporu na određeni stopa. Zbog razlika kemijskih svojstava različitih baza na lancu DNA/RNA, kada jedna baza ili molekula DNA prolazi kroz kanal nanopora, to će uzrokovati promjenu različitih električnih signala. Otkrivanjem i odgovarajućim tim signalima mogu se izračunati odgovarajuće tipove baze, a otkrivanje niza u stvarnom vremenu može se dovršiti.

Kontaktirajte nas

Pojedinosti o usluzi

Demo rezultat

Pojedinosti o usluzi

Platforma	Veličina knjižnice	Teoretski prinos podataka (po ćeliji)	Točnost jednostruke baze	Prijava
Nanopora	8kb, 10kb, 20kb, ultralong, cDNA-PCR	70-90GB/ćelija	85-92%	SV pozivanje, de novo, sekvenciranje pune duljine, ISO-Seq, napomena gena, otkrivanje metilacije DNA

Prednosti usluge

● preko 5 godina iskustva na platformi za sekvenciranje Pacbio s tisućama zatvorenih projekata s različitim vrstama.
● BMKGENE je službeni partner Oxford Nanopore, s dvostrukom certifikatom RNA/DNA platforme.
● Postoje glavni modeli sekvence s potpunom opremom i dovoljnom propusnošću sekvenciranja.
● Na temelju platforme Nanopore, u međunarodno poznatim časopisima objavljeno je više od 10 istraživanja životinja i biljaka.

Zahtjevi za uzorkovanje

Vrsta uzorka

Iznositi

Koncentment (Qubit ®)

Volumen

Čistoća

Drugi

Genomska DNK

Ovisi o zahtjevu podataka

≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1.5 ；

Jasan vrh na 260 nm ， bez onečišćenja

Koncentraciju treba mjeriti Qubit i Qubit/nanopore ≤ 2

Ukupna RNA

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ； Bez onečišćenja

RIN vrijednost ≥7,5

Servisni tijek rada

Priprema uzorka

Konstrukcija knjižnice

Sekvenciranje

Analiza podataka

Dostava projekta

Prethodno: Illumina unaprijed napravljene knjižnice

Sljedeći: Specifično-lokus pojačano sekvenciranje fragmenta (SLAF-seq)

Procjena kvalitete podataka uzorka DNK

Tablica 1. Statistika o čistim podacima.

Bmkid	rawseqnum	sirova	čišćenje	čistač	čist50len	čist90LEN	Cleanmeanlen	CleanMaxlen	CleanMeanqual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143.181	9