ריצוף mRNA אאוקריוטי - NGS
תכונות
● הכנת ספריית mRNA כיוונית אופציונלית המאפשרת קבלת נתוני ריצוף ספציפיים לגדיל
● ניתוחי BI שונים מכסים את כל צרכי הלקוחות שלנו
יתרונות
●מומחיות נרחבתעיבדנו למעלה מ-600,000 דגימות, המקיפות סוגי דגימות מגוונים כגון תרביות תאים, רקמות ונוזלי גוף. אנו מביאים את שפע המומחיות שלנו לכל פרויקט.
●בקרת איכות קפדניתאנו מיישמים נקודות בקרה מרכזיות בכל השלבים, החל מהכנת דגימות ועד להכנת ספרייה, ריצוף וביואינפורמטיקה. הניטור הקפדני שלנו מבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
●ביאור מקיףאנו משתמשים במספר מסדי נתונים כדי לסמן פונקציונלית את הגנים המתבטאים באופן דיפרנציאלי (DEGs) ולבצע ניתוחי העשרה תואמים. גישה מקיפה זו מספקת תובנות לגבי התהליכים התאיים והמולקולריים העומדים בבסיס תגובת הטרנסקריפטום, ומבטיחה שתקבלו את כל המידע האפשרי על נתוני הניסוי שלכם.
●תמיכה לאחר המכירהאנו מבינים עד כמה חשוב להיות נוכחים, ולכן המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט, עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ופגישות שאלות ותשובות כדי לענות על כל שאלה הקשורה לתוצאות.
דרישות לדוגמה ומשלוח
| סִפְרִיָה | אסטרטגיית ריצוף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| מועשר בפולי A | אילומינה PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 ג'יגה-בייט | Q30≥85% |
דרישות לדוגמה:
נוקלאוטידים:
דרישות מינימליות לדוגמה:
| ריכוז (ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | שְׁלֵמוּת | |
| ספרייה סטנדרטית | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 זיהום חלבון או DNA מוגבל או ללא זיהום כלל על גבי הג'ל. | עבור צמחים: RIN≥4.0; עבור בעלי חיים: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; גובה בסיס מוגבל או ללא גובה בסיס |
| ספריית כיוונים | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 זיהום חלבון או DNA מוגבל או ללא זיהום כלל על גבי הג'ל. | עבור צמחים: RIN≥4.0; עבור בעלי חיים: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; גובה בסיס מוגבל או ללא גובה בסיס |
| צמחים | חַיָה | פרוקי רגליים | דם מלא | תאים |
| שורש, גבעול או עלה כותרת: 450 מ"ג עלה או זרע: 300 מ"ג פרי: 1.2 גרם | לב או מעיים: 300 מ"ג קרביים או מוח: 240 מ"ג שריר: 450 מ"ג עצמות, שיער או עור: 1 גרם | חרקים: 6 גרם סרטנאים: 300 מ"ג | שפופרת אחת | 106 תאים |
משלוח דוגמיות מומלץ
מיכל: צינור צנטריפוגה 2 מ"ל (לא מומלץ להשתמש בנייר אלומיניום)
תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפול לדוגמה A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז את הדגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.
2. מבחנות ייצוב RNA: ניתן לייבש דגימות RNA במבחנות ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח אותן בטמפרטורת החדר.
דרישות לדוגמה ומשלוח
תכנון הניסוי
משלוח לדוגמה
מיצוי RNA
בניית ספרייה
ריצוף
ניתוח נתונים
שירותי לאחר המכירה
ביואינפורמטיקה
עבור דגימות עם גנום ייחוס זמין, ניתוח ה-BI הוא כדלקמן:
Øבקרת איכות נתונים גולמיים
Øיישור גנום ייחוס
Øניתוח מבנה התעתיק
Øכימות ביטוי
Øניתוח ביטוי דיפרנציאלי
Øביאור והעשרה של פונקציות
עבור דגימות ללא גנום ייחוס, זוהי האפשרות הזמינה:
• בקרת איכות נתונים גולמיים
•הרכבה עם אופטימיזציה של מבנה
•ניתוח ביטוי דיפרנציאלי
•ביאור והעשרה של פונקציות
יישור גנום ייחוס
רווית נתונים
קורלציה של דגימות והערכת שכפולים ביולוגיים
גנים המתבטאים באופן דיפרנציאלי (DEGs)
ביאור פונקציונלי של DEGs
העשרה פונקציונלית של DEGs
גלו את ההתקדמות שמאפשרות שירותי ריצוף ה-mRNA של NGS אאוקריוטיים של BMKGene באמצעות אוסף פרסומים שנבחרו בקפידה.
הואנג, ל. ואחרים (2023) 'טריקלוסן וטריקלוקרבן מחלישים את יכולת הריח של דגי זהב על ידי הגבלת זיהוי חומרי ריח, שיבוש העברת אותות ריח, והפרעה לעיבוד מידע ריח',מחקר מים, 233, עמ' 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
ג'יה, ל.ג'. ואחרים (2023) 'אספרגילוס פומיגטוס חוטף את p11 האנושי כדי להפנות פגוזומים המכילים פטריות למסלול שאינו מתפרק',תא מארח וחיידק, 31(3), עמ' 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
ג'ין, ק. ואחרים (2022) 'גורמי שעתוק TCP המעורבים בהתפתחות נצרים של במבוק מא (Dendrocalamus latiflorus Munro)',גבולות במדעי הצמח, 13, עמ' 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
וון, ש. ואחרים (2022) 'הגנום של חרצית לבנדוליפוליום והמנגנון המולקולרי העומד בבסיס סוגי קפיטולום מגוונים',מחקר גננות, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
ג'אנג, יוג'י ואחרים (2023) 'ננו-ריאקטור קסדה לשיפור טיפול סונודינמי בסרטן המעי הגס באמצעות הגדלת ROS סינרגטית וחסימת אוטופגיה',ננו היום, 49, עמ'. 101798. דוי: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
