רצף mRNA אוקריוטי-אילומינה
יתרונות
Øבעל ניסיון רב: למעלה מ-200,000 דגימות עובדו ב-BMK המכסות סוגי דגימות מגוונים, כולל תרבית תאים, רקמות, נוזל גוף וכו', ולמעלה מ-7,000 פרויקטים של mRNA-Seq נסגרו המכסים תחומי מחקר שונים.
Øמערכת בקרת איכות קפדנית: נקודות בקרת איכות ליבה בכל השלבים, כולל הכנת דגימות, הכנת ספרייה, רצף וביואינפורמטיקה נמצאות במעקב צמוד על מנת לספק תוצאות באיכות גבוהה.
Øמסדי נתונים מרובים זמינים למחקרי ביאור פונקציות והעשרה כדי להגשים מטרות מחקר מגוונות.
Øשירותים לאחר המכירה: שירותי לאחר המכירה תקפים ל-3 חודשים עם סיום הפרויקט, כולל מעקב פרויקטים, איתור תקלות, שאלות ותשובות לתוצאות וכו'.
דרישות לדוגמא ומשלוח
| סִפְרִיָה | אסטרטגיית רצף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| פולי A מועשר | Illumina PE150 | 6 ג'יגה-בייט | Q30≥85% |
דרישות לדוגמה:
נוקלאוטידים:
| טוֹהַר | יושרה | כמות |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA מוצג על ג'ל. | לצמחים: RIN≥6.5; לבעלי חיים: RIN≥7;28S/18S≥1.0; גובה בסיס מוגבל או ללא | קונצרן≥30 ng/μl;נפח ≥ 10 μl;סך הכל ≥ 1.5 מיקרוגרם |
רקמה: משקל (יבש):≥1 גרם
*עבור רקמה קטנה מ-5 מ"ג, אנו ממליצים לשלוח דגימת רקמה קפואה (בחנקן נוזלי).
השעיה תא:ספירת תאים = 3×106- 1×107
*אנו ממליצים לשלוח lysate תאים קפואים.במקרה שהתא הזה קטן מ-5×105, מומלץ להקפיא בחנקן נוזלי, שעדיף למיצוי מיקרו.
דגימות דם:נפח≥1 מ"ל
בַּקטֶרִיָה:מסה ≥ 1 גרם
משלוח לדוגמא מומלץ
מיכל: שפופרת צנטריפוגה 2 מ"ל (לא מומלץ נייר כסף)
תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפל למשל A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
מִשׁלוֹחַ:
- קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.
- צינורות RNAstable: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודה בשירות
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
מיצוי RNA
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
ביואינפורמטיקה
איקריוטי זרימת עבודה של ניתוח רצף mRNA
ביואינפורמטיקה
Øבקרת איכות נתונים גולמיים
Øיישור גנום התייחסות
Øניתוח מבנה תמלול
Øכימות ביטוי
Øניתוח ביטוי דיפרנציאלי
Øביאור פונקציה והעשרה
1.עקומת רוויה של נתוני mRNA
2.ניתוח ביטוי דיפרנציאלי- עלילת הר געש
3.הערת KEGG על DEGs
4.סיווג GO על DEGs
