גנום פטרייתי
יתרונות השירות
● אסטרטגיות רצף מרובות זמינות למטרות מחקר שונות
● בעל ניסיון רב בהרכבת גנום פטריות עם למעלה מ-10,000 גנום מלא של פן.
● צוות תמיכה טכנית מקצועית לאחר המכירה הממלאת צורכי מחקר ספציפיים יותר.
מפרט שירות
| שֵׁרוּת | אסטרטגיית רצף | איכות מובטחת | זמן אחזור משוער |
| מפה עדינה פטרייתית | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 ימי עבודה |
| PacBio HiFi 30X | |||
| מפה מלאה בפני פטריות | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | יחס עיגון כרומוזומים >90% | 45 ימי עבודה |
ניתוח ביואינפורמטיקה
● בקרת איכות נתונים גולמיים
● הרכבת הגנום
● ניתוח רכיבי הגנום
● ביאור פונקציית גנים
● ניתוח גנומי השוואתי
דרישות לדוגמא ומשלוח
דרישות לדוגמה:
לתמציות DNA:
| סוג דגימה | כמות | ריכוז | טוֹהַר |
| תמציות DNA | ＞ 1.2 מיקרוגרם | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
לדגימות רקמה:
| סוג דגימה | טיפול מדגם מומלץ | אחסון ומשלוח לדוגמא |
| פטריה חד-תאית | התבונן בשמרים תחת מיקרוסקופ ואסוף אותם בשלב האקספוננציאלי שלהם העבירו את התרבות (המכילה כ 3-4.5e9 תאים) לתוך eppendorf 1.5 או 2 מ"ל.(שמור על הקרח) צנטריפו את הצינור למשך דקה אחת ב-14000 גרם כדי לאסוף חיידקים ולהסיר את הסופרנטנט בזהירות אטום את הצינור והקפיא את החיידקים בחנקן נוזלי למשך 1-3 שעות לפחות.אחסן את השפופרת במקרר -80 ℃. | הקפיאו את הדגימות בחנקן נוזלי למשך 3-4 שעות ואחסנו בחנקן נוזלי או -80 מעלות לשמירה לטווח ארוך.נדרש משלוח לדוגמא עם קרח יבש. |
| פטריית מאקרו | מומלץ רקמות בשלב גידול פעיל. שטפו את הרקמה במים נטולי אנדוטוקסין, ולאחר מכן 70% אתונלי. שמור את המדגם ב-cryo-tubes. |
זרימת עבודה בשירות
משלוח לדוגמא
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
1. דיאגרמת Circos על רכיבים גנומיים פטרייתיים
2. ניתוח גנומי השוואתי: עץ פילוגנטי
