RNA kecil

RNA kecil adalah RNA non-pengkode pendek dengan panjang rata-rata 18-30 nt, termasuk miRNA, siRNA, dan piRNA, yang memainkan peran penting dalam proses regulasi. Pipeline BMKCloud sRNA menyediakan analisis standar dan kustom untuk identifikasi miRNA. Setelah pemangkasan bacaan dan kontrol kualitas, bacaan diselaraskan dengan beberapa basis data untuk mengklasifikasikan sRNA dan memilih miRNA serta dipetakan ke genom referensi. miRNA diidentifikasi berdasarkan basis data miRNA yang dikenal, memberikan informasi tentang struktur sekunder, famili miRNA, dan gen target. Analisis ekspresi diferensial mengidentifikasi miRNA yang diekspresikan secara diferensial dan gen target yang sesuai dianotasi secara fungsional untuk menemukan kategori yang diperkaya.