Lyts RNA

Lytse RNA's binne koarte net-kodearjende RNA's mei in gemiddelde lingte fan 18-30 nt, ynklusyf miRNA, siRNA en piRNA, dy't wichtige rollen spylje yn regeljouwingsprosessen. De BMKCloud sRNA-pipeline leveret sawol standert as oanpaste analyze foar miRNA-identifikaasje. Nei it trimmen fan lêzen en kwaliteitskontrôle wurde lêzingen ôfstimd tsjin meardere databases om sRNA's te klassifisearjen en miRNA's te selektearjen en yn kaart te bringen oan it referinsjegenoom. miRNA's wurde identifisearre op basis fan bekende miRNA-databases, en leverje ynformaasje oer sekundêre struktuer, miRNA-famylje en doelgenen. Differinsjele ekspresje-analyze identifisearret ferskillend útdrukte miRNA's en de oerienkommende doelgenen wurde funksjoneel annotearre om ferrike kategoryen te finen.