Maliit na RNA

Ang maliliit na RNA ay maiikling non-coding RNA na may average na haba na 18-30 nt, kabilang ang miRNA, siRNA at piRNA, na gumaganap ng mahahalagang papel sa mga proseso ng regulasyon. Ang pipeline ng BMKCloud sRNA ay nagbibigay ng parehong pamantayan at pasadyang pagsusuri para sa pagkakakilanlan ng miRNA. Pagkatapos ng read trimming at quality control, ang mga pagbasa ay inihahanay laban sa maraming database upang uriin ang mga sRNA at piliin ang mga miRNA at imapa sa reference genome. Ang mga miRNA ay kinikilala batay sa mga kilalang database ng miRNA, na nagbibigay ng impormasyon sa pangalawang istruktura, pamilya ng miRNA at mga target gene. Kinikilala ng differential expression analysis ang mga miRNA na may magkakaibang pagpapahayag at ang mga kaukulang target gene ay nilagyan ng functionally annotation upang mahanap ang mga enriched na kategorya.