Lite RNA

Små RNA er korte ikke-kodende RNA med en gjennomsnittlig lengde på 18-30 nt, inkludert miRNA, siRNA og piRNA, som spiller viktige roller i regulatoriske prosesser. BMKCloud sRNA-rørledningen gir både standard og tilpasset analyse for miRNA-identifikasjon. Etter å ha lest trimming og kvalitetskontroll, justeres avlesningene mot flere databaser for å klassifisere sRNA og velge miRNA og kartlegges til referansegenomet. miRNA er identifisert basert på kjente miRNA-databaser, og gir informasjon om sekundær struktur, miRNA-familie og målgener. Differensiell ekspresjonsanalyse identifiserer differensielt uttrykte miRNA-er, og de tilsvarende målgenene er funksjonelt kommentert for å finne berikede kategorier.