Μικρό RNA

Τα μικρά RNA είναι σύντομα μη κωδικοποιητικά RNA με μέσο μήκος 18-30 nt, συμπεριλαμβανομένων των miRNA, siRNA και piRNA, τα οποία παίζουν σημαντικό ρόλο στις ρυθμιστικές διαδικασίες. Ο αγωγός sRNA του BMKCloud παρέχει τόσο τυπική όσο και προσαρμοσμένη ανάλυση για την αναγνώριση miRNA. Μετά την περικοπή των αναγνώσεων και τον ποιοτικό έλεγχο, οι αναγνώσεις ευθυγραμμίζονται με πολλαπλές βάσεις δεδομένων για την ταξινόμηση των sRNA και την επιλογή miRNA και την αντιστοίχισή τους στο γονιδίωμα αναφοράς. Τα miRNA αναγνωρίζονται με βάση γνωστές βάσεις δεδομένων miRNA, παρέχοντας πληροφορίες για τη δευτεροταγή δομή, την οικογένεια miRNA και τα γονίδια-στόχους. Η ανάλυση διαφορικής έκφρασης αναγνωρίζει τα διαφορικά εκφραζόμενα miRNA και τα αντίστοιχα γονίδια-στόχοι σχολιάζονται λειτουργικά για την εύρεση εμπλουτισμένων κατηγοριών.