Litet RNA

Små RNA är korta icke-kodande RNA med en genomsnittlig längd på 18–30 nt, inklusive miRNA, siRNA och piRNA, vilka spelar viktiga roller i regleringsprocesser. BMKClouds sRNA-pipelin erbjuder både standard- och anpassad analys för miRNA-identifiering. Efter trimning av läsningar och kvalitetskontroll justeras läsningarna mot flera databaser för att klassificera sRNA och välja ut miRNA, vilka sedan mappas till referensgenomet. miRNA identifieras baserat på kända miRNA-databaser, vilket ger information om sekundärstruktur, miRNA-familj och målgener. Differentiell expressionsanalys identifierar differentiellt uttryckta miRNA och motsvarande målgener annoteras funktionellt för att hitta berikade kategorier.