Maza RNS

Mazās RNS ir īsas nekodējošas RNS ar vidējo garumu 18–30 nt, tostarp miRNA, siRNA un piRNA, kurām ir svarīga loma regulēšanas procesos. BMKCloud sRNA cauruļvads nodrošina gan standarta, gan pielāgotu analīzi miRNA identificēšanai. Pēc nolasījumu apgriešanas un kvalitātes kontroles nolasījumi tiek salīdzināti ar vairākām datubāzēm, lai klasificētu sRNA un atlasītu miRNA, un kartētu tos atsauces genomā. miRNA tiek identificētas, pamatojoties uz zināmām miRNA datubāzēm, sniedzot informāciju par sekundāro struktūru, miRNA saimi un mērķa gēniem. Diferenciālās ekspresijas analīze identificē diferencēti ekspresētas miRNA, un atbilstošie mērķa gēni tiek funkcionāli anotēti, lai atrastu bagātinātas kategorijas.