Mały RNA

Małe RNA to krótkie niekodujące RNA o średniej długości 18-30 nt, w tym miRNA, siRNA i piRNA, które odgrywają ważną rolę w procesach regulacyjnych. System BMKCloud sRNA oferuje zarówno standardową, jak i niestandardową analizę do identyfikacji miRNA. Po przycięciu odczytów i kontroli jakości, odczyty są porównywane z wieloma bazami danych w celu klasyfikacji sRNA i wyselekcjonowania miRNA, a następnie mapowane na genom referencyjny. MiRNA są identyfikowane na podstawie znanych baz danych miRNA, dostarczając informacji na temat struktury drugorzędowej, rodziny miRNA i genów docelowych. Analiza ekspresji różnicowej identyfikuje miRNA o zróżnicowanej ekspresji, a odpowiadające im geny docelowe są funkcjonalnie adnotowane w celu znalezienia wzbogaconych kategorii.