Piccolo RNA

Gli small RNA sono brevi RNA non codificanti con una lunghezza media di 18-30 nt, inclusi miRNA, siRNA e piRNA, che svolgono un ruolo importante nei processi regolatori. La pipeline sRNA di BMKCloud fornisce analisi standard e personalizzate per l'identificazione dei miRNA. Dopo il trimming e il controllo di qualità, le letture vengono allineate con più database per classificare gli sRNA e selezionare i miRNA, per poi essere mappate sul genoma di riferimento. I miRNA vengono identificati sulla base di database di miRNA noti, fornendo informazioni sulla struttura secondaria, sulla famiglia di miRNA e sui geni target. L'analisi dell'espressione differenziale identifica i miRNA differenzialmente espressi e i geni target corrispondenti vengono annotati funzionalmente per trovare categorie arricchite.