
Pieni RNA
Pienet RNA:t ovat lyhyitä ei-koodaavia RNA:ita, joiden keskipituus on 18-30 nt, mukaan lukien miRNA, siRNA ja piRNA, joilla on tärkeä rooli säätelyprosesseissa. BMKCloud sRNA-putki tarjoaa sekä standardin että mukautetun analyysin miRNA-tunnistukseen. Lukemisen leikkaamisen ja laadunvalvonnan jälkeen lukemat kohdistetaan useisiin tietokantoihin sRNA:iden luokittelemiseksi ja miRNA:iden valitsemiseksi ja kartoitetaan vertailugenomiin. miRNA:t tunnistetaan tunnettujen miRNA-tietokantojen perusteella, jotka tarjoavat tietoa sekundaarirakenteesta, miRNA-perheestä ja kohdegeeneistä. Differentiaalinen ilmentymisanalyysi tunnistaa eri tavalla ilmentyneet miRNA:t ja vastaavat kohdegeenit merkitään toiminnallisesti rikastettujen kategorioiden löytämiseksi.
Bioinformatiikan työnkulku
