Malá RNA

Malé RNA jsou krátké nekódující RNA s průměrnou délkou 18–30 nt, včetně miRNA, siRNA a piRNA, které hrají důležitou roli v regulačních procesech. BMKCloud sRNA pipeline poskytuje standardní i zakázkovou analýzu pro identifikaci miRNA. Po ořezání čtených sekvencí a kontrole kvality jsou čtené sekvence porovnány s více databázemi za účelem klasifikace sRNA a výběru miRNA a mapování na referenční genom. miRNA jsou identifikovány na základě známých databází miRNA, což poskytuje informace o sekundární struktuře, rodině miRNA a cílových genech. Analýza diferenciální exprese identifikuje diferenciálně exprimované miRNA a odpovídající cílové geny jsou funkčně anotovány za účelem nalezení obohacených kategorií.