Sequenziamentu di l'ARNm eucarioticu-NGS
Funziunalità
● Preparazione opzionale di a biblioteca di mRNA direzionale per permette l'ottenimentu di dati di sequenziamentu specifichi di u filamentu
● Diverse analisi BI coprenu tutti i bisogni di i nostri clienti
Vantaghji
●Una vasta cumpetenzaAvemu trattatu più di 600 000 campioni, chì abbraccianu diversi tipi di campioni cum'è culture cellulari, tessuti è fluidi corporei. Purtemu a ricchezza di a nostra cumpetenza à ogni prughjettu.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di i campioni à a preparazione di e biblioteche, u sequenziamentu è a bioinformatica. U nostru monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
●Annotazione cumpletaAdupremu parechje basi di dati per annotà funziunalmente i Geni Espressi Differenzialmente (DEG) è realizà analisi d'arricchimentu currispondenti. Questu approcciu cumpletu furnisce infurmazioni nantu à i prucessi cellulari è moleculari chì sò à a basa di a risposta di u trascrittoma, assicurendu chì uttene tutte l'infurmazioni pussibuli nantu à i dati di u vostru esperimentu.
●Assistenza post-venditaCapimu quantu hè impurtante esse presente, hè per quessa chì u nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
Requisiti di Campione è Cunsegna
| Biblioteca | Strategia di sequenziamentu | Dati cunsigliati | Cuntrollu di qualità |
| Arricchitu cù Poly A | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
Requisiti di u campione:
Nucleotidi:
Requisiti minimi di campione:
| Cunc. (ng/μl) | Quantità (μg) | Purezza | Integrità | |
| Biblioteca Standard | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cuntaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | Per e piante: RIN≥4.0; Per l'animali: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazione di basa limitata o inesistente |
| Biblioteca Direzionale | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cuntaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | Per e piante: RIN≥4.0; Per l'animali: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazione di basa limitata o inesistente |
| Piante | Animale | Artropodi | Sangue interu | Cellule |
| Radice, fustu o petalu: 450 mg Foglia o Seme: 300 mg Frutta: 1,2 g | Core o Intestinu: 300 mg Viscera o Cervellu: 240 mg Musculu: 450 mg Ossa, Capelli o Pelle: 1g | Insetti: 6g Crustacei: 300 mg | 1 tubu | 106 cellule |
Cunsegna di Campioni Raccomandata
Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 ml (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)
Esempiu di etichettatura: Gruppu + replica per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Spedizioni:
1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi di tavola di RNA: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di l'RNA (per esempiu, RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.
Requisiti di Campione è Cunsegna
Cuncepimentu di l'esperimentu
Cunsegna di campioni
Estrazione di ARN
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
Bioinformatica
Per i campioni cù un genomu di riferimentu dispunibule, l'analisi BI hè a seguente:
ØCuntrollu di a qualità di i dati crudi
ØAllineamentu di u genomu di riferimentu
ØAnalisi di a struttura di a trascrizione
ØQuantificazione di l'espressione
ØAnalisi di l'espressione differenziale
ØAnnotazione è arricchimentu di e funzioni
Per i campioni senza un genomu di riferimentu, eccu l'opzione dispunibile:
• Cuntrollu di a qualità di i dati crudi
•Assemblaggio cù ottimizazione di a struttura
•Analisi di l'espressione differenziale
•Annotazione è arricchimentu di e funzioni
Allineamentu di u Genomu di Riferimentu
Saturazione di i dati
Correlazione di campioni è valutazione di repliche biologiche
Geni espressi differenzialmente (DEG)
Annotazione funzionale di i DEG
Arricchimentu funzionale di i DEG
Esplora i progressi facilitati da i servizii di sequenziamentu di l'ARNm eucarioticu NGS di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Huang, L. et al. (2023) 'U triclosan è u triclocarban indebuliscenu a capacità olfattiva di i pesci rossi limitendu u ricunniscimentu di l'odori, interrompendu a trasduzione di u signale olfattivu è disturbendu l'elaborazione di l'infurmazioni olfattive',Ricerca nantu à l'acqua, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus dirotta p11 umana per ridirizionà i fagosomi chì cuntenenu funghi versu una via non degradativa',Ospite cellulare è microbu, 31 (3), pp. 373-388.e10. doi : 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Fattori di trascrizione TCP implicati in u sviluppu di germogli di Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)',Frontiere in Scienza Vegetale, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'U genomu di Chrysanthemum lavandulifolium è u mecanismu moleculare chì sottende à diversi tipi di capitulum',Ricerca in Orticultura, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Un nanoreattore à cascata per migliurà a terapia sonodinamica nantu à u cancru colorectal via l'aumentu sinergicu di ROS è u bloccu di l'autofagia',Nano Oghje, 49, p. 101798. doi : 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
