I prudutti

Genoma fungicu

Tecnulugii di Biomarker furnisce indagine di genoma, genoma fine è genoma pene-completu di fungi secondu u scopu di ricerca specificu.A sequenza di u genoma, l'assemblea è l'annotazione funzionale ponu esse ottenute cumminendu a sequenza di a prossima generazione + a sequenza di a terza generazione per ottene l'assemblea di genoma di altu livellu.A tecnulugia Hi-C pò ancu esse impiegata per facilità l'assemblea di u genoma à u livellu di u cromusomu.

piattaforma:PacBio Sequel II

Nanopore PromethION P48

Piattaforma Illumina NovaSeq

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Dettagli di serviziu

Risultati Demo

Vantaghji di serviziu

● Strategie di sequenza multiplici dispunibuli per diversi scopi di ricerca

● Altamente espertu in l'assemblea di u genoma di fungi cù più di 10 000 genoma pene-complete assemblatu.

● Prufessiunali dopu-vendita squatra di supportu tecnicu cumpiendu bisogni di ricerca più specifichi.

Specificazioni di serviziu

serviziu	Strategia di sequenza	Qualità garantita	Tempu di turn-around stimatu
Mappa fine fungale	Illumina 50X + Nanopore 100X	Conti N50≥2 Mb	35 ghjorni di travagliu
Mappa fine fungale	PacBio HiFi 30X	Conti N50≥2 Mb	35 ghjorni di travagliu
Fungi pene-completa mappa	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Rapportu di ancoratura cromosomica > 90%	45 ghjorni di travagliu

Analisi bioinformatica

● cuntrollu di qualità di dati crudu

● Assemblea Genome

● Analisi di cumpunenti Genome

● Annotazione di funzione genica

● Analisi genomica comparativa

Requisiti di mostra è consegna

Requisiti di mostra:

Perestratti di DNA:

Tipu di mostra	A quantità	Cuncentrazione	Purità
estratti di DNA	＞ 1,2 μg	> 20 ng/μl	OD260/280 = 1,6-2,5

Per i campioni di tissuti:

Tipu di mostra

Trattamentu di mostra cunsigliatu

Conservazione di mostra è spedizione

Fungo unicellulare

Osservate u levitu sottu u microscopiu è cullà in a so fase esponenziale

Trasferisce a cultura (contene circa 3-4.5e9 cells) in un eppendorf 1,5 o 2 ml.(Mantene nantu à u ghjacciu)

Centrifuga u tubu per 1 min à 14000 g per cullà i batteri è sguassate u supernatant cun cura.

Seal the tube and freeze the bacteria in nitrogenu liquidu per almenu 1-3 h.Mantene u tubu in u frigorifero -80 ℃.

Freeze i campioni in nitrogenu liquidu per l'ora di 3-4 è almacenà in nitrogenu liquidu o -80 gradi à riservazione longu.U trasportu di mostra cù ghiaccio seccu hè necessariu.

Macro Fungus

U tissutu in fase di crescita attiva hè cunsigliatu.

Risciacquate u tissutu cù acqua senza endotossina, dopu 70% ethonal.

Salvà a mostra in crio-tubi.