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Sequenziamentu di l'exoma interu umanu

U sequenziamentu di l'exoma umanu sanu (hWES) hè largamente ricunnisciutu cum'è un approcciu di sequenziamentu efficace in termini di costi è putente per identificà e mutazioni chì causanu malatie. Malgradu custituiscenu solu circa l'1,7% di u genomu sanu, l'esoni ghjocanu un rolu cruciale riflettendu direttamente u prufilu di e funzioni totali di e proteine. In particulare, in u genomu umanu, più di l'85% di e mutazioni relative à e malatie si manifestanu in e regioni codificanti e proteine. BMKGENE offre un serviziu cumpletu è flessibile di sequenziamentu di l'exoma umanu sanu cù duie diverse strategie di cattura di esoni dispunibili per risponde à diversi obiettivi di ricerca.


Dettagli di u serviziu

Risultati di a Dimostrazione

Funzioni di serviziu

● Dui pannelli d'exomi dispunibili basati annantu à l'arricchimentu di u target cù sonde: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) è xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sequenziamentu nantu à Illumina NovaSeq.

● Pipeline bioinformaticu direttu versu l'analisi di e malatie o l'analisi di u tumore.

Vantaghji di u serviziu

Regione codificante di proteine ​​​​​​di destinazioneCatturendu è sequenziendu e regioni codificanti e proteine, hWES hè utilizatu per revelà varianti relative à a struttura di e proteine.

Efficace in termini di costi:hWES produce circa l'85% di e mutazioni assuciate à e malatie umane da l'1% di u genomu umanu.

Alta precisioneCù una prufundità di sequenziamentu elevata, hWES facilita a rilevazione di varianti cumuni è varianti rare cù frequenze inferiori à 1%.

Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu cinque punti di cuntrollu principali in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteche à u sequenziamentu è a bioinformatica. Stu monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.

Analisi Bioinformatica CumpletaA nostra pipeline va oltre l'identificazione di variazioni di u genomu di riferimentu, postu chì incorpora analisi avanzate cuncepite per risponde specificamente à dumande di ricerca relative à aspetti genetichi di e malatie o analisi di tumori.

Assistenza post-vendita:U nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.

Specifiche di Campione

Strategia di Cattura di l'Esoni

Strategia di Sequenziamentu

Output di dati cunsigliatu

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

o xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5-10 Gb

Per i disordini mendeliani/malatie rare: > 50x

Per i campioni di tumore: ≥ 100x

Requisiti di Campione

Tipu di campione

 

 Quantità(Qubit®)

 

Cuncentrazione 

Volume

 

 

 Purità (NanoDrop™)

 

ADN genomicu

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1.8-2.0
 
nisuna degradazione, nisuna contaminazione

 

Bioinformatica

Flussu di travagliu WES_BI_Malattia-01

L'analisi bioinformatica di i campioni di a malatia hWES include:

● QC di i dati di sequenziamentu

● Allineamentu di u Genomu di Riferimentu

● Identificazione di SNP è InDels

● Annotazione funzionale di SNP è InDels

Flussu di travagliu WES_BI_Tumor-01

L'analisi bioinformatica di campioni di tumore include:

● QC di i dati di sequenziamentu

● Allineamentu di u Genomu di Riferimentu

● Identificazione di SNP, InDels è variazioni somatiche

● Identificazione di varianti germinali

● Analisi di e firme di mutazione

● Identificazione di geni impulsivi basati annantu à mutazioni di guadagnu di funzione

● Annotazione di mutazione à u livellu di suscettibilità à i medicinali

● Analisi di l'eterogeneità - calculu di a purità è di a ploidia

Flussu di travagliu di serviziu

consegna di campioni

Cunsegna di campioni

Esperimentu pilotu

Estrazione di DNA

Preparazione di a Biblioteca

Custruzzione di a biblioteca

Sequenziamentu

Sequenziamentu

Analisi di dati

Analisi di dati

数据上传-01

Trasmissione di dati

Servizii dopu a vendita

Servizii dopu a vendita


  • Precedente:
  • Dopu:

  • QC di i dati - Statistiche di a cattura di l'exoma

     

    wps_doc_22

     

    Identificazione di variante – InDels

    图片36

    Analisi avanzata: identificazione è distribuzione di SNP/InDels deleteri - Graficu di Circos

     

    图片37

    Analisi di u tumore: identificazione è distribuzione di mutazioni somatiche - Diagramma di Circos

     

    图片38

     

    Analisi di u tumore: lignaggi clonali

     

    图片39

     

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