● Dui pannelli d'exomi dispunibili basati annantu à l'arricchimentu di u target cù sonde: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) è xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).
● Sequenziamentu nantu à Illumina NovaSeq.
● Pipeline bioinformaticu direttu versu l'analisi di e malatie o l'analisi di u tumore.
●Regione codificante di proteine di destinazioneCatturendu è sequenziendu e regioni codificanti e proteine, hWES hè utilizatu per revelà varianti relative à a struttura di e proteine.
●Efficace in termini di costi:hWES produce circa l'85% di e mutazioni assuciate à e malatie umane da l'1% di u genomu umanu.
●Alta precisioneCù una prufundità di sequenziamentu elevata, hWES facilita a rilevazione di varianti cumuni è varianti rare cù frequenze inferiori à 1%.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu cinque punti di cuntrollu principali in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteche à u sequenziamentu è a bioinformatica. Stu monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
●Analisi Bioinformatica CumpletaA nostra pipeline va oltre l'identificazione di variazioni di u genomu di riferimentu, postu chì incorpora analisi avanzate cuncepite per risponde specificamente à dumande di ricerca relative à aspetti genetichi di e malatie o analisi di tumori.
●Assistenza post-vendita:U nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
| Strategia di Cattura di l'Esoni | Strategia di Sequenziamentu | Output di dati cunsigliatu |
| Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) o xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)
| Illumina NovaSeq PE150 | 5-10 Gb Per i disordini mendeliani/malatie rare: > 50x Per i campioni di tumore: ≥ 100x |
| Tipu di campione
| Quantità(Qubit®)
| Cuncentrazione | Volume
| Purità (NanoDrop™) |
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ADN genomicu
| ≥ 50 ng | ≥ 6 ng/μL | ≥ 15 μL | OD260/280=1.8-2.0 nisuna degradazione, nisuna contaminazione
|
L'analisi bioinformatica di i campioni di a malatia hWES include:
● QC di i dati di sequenziamentu
● Allineamentu di u Genomu di Riferimentu
● Identificazione di SNP è InDels
● Annotazione funzionale di SNP è InDels
L'analisi bioinformatica di campioni di tumore include:
● QC di i dati di sequenziamentu
● Allineamentu di u Genomu di Riferimentu
● Identificazione di SNP, InDels è variazioni somatiche
● Identificazione di varianti germinali
● Analisi di e firme di mutazione
● Identificazione di geni impulsivi basati annantu à mutazioni di guadagnu di funzione
● Annotazione di mutazione à u livellu di suscettibilità à i medicinali
● Analisi di l'eterogeneità - calculu di a purità è di a ploidia
QC di i dati - Statistiche di a cattura di l'exoma
Identificazione di variante – InDels
Analisi avanzata: identificazione è distribuzione di SNP/InDels deleteri - Graficu di Circos
Analisi di u tumore: identificazione è distribuzione di mutazioni somatiche - Diagramma di Circos
Analisi di u tumore: lignaggi clonali