● Dui pannelli d'exomi dispunibili basati annantu à l'arricchimentu di u target cù sonde: SureSelect Human All Exon v6 (Agilent) è xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).
- Basatu annantu à u pannellu SureSelect Human All Exon V6, e regioni UTR è u mtDNA di lunghezza cumpleta sò supplementati à l'intervallu di cattura di u bersagliu.
- A custruzzione di biblioteche abilitate per UMI hè dispunibule cù u pannellu SureSelect Human All Exon V6.
● Sequenziamentu nantu à Illumina NovaSeq.
● Pipeline bioinformaticu direttu versu l'analisi di e malatie o l'analisi di u tumore.
●Regione codificante di proteine di destinazioneCatturendu è sequenziendu e regioni codificanti e proteine, hWES hè utilizatu per revelà varianti relative à a struttura di e proteine.
●Efficace in termini di costi:hWES produce circa l'85% di e mutazioni assuciate à e malatie umane da l'1% di u genomu umanu.
●Alta precisioneCù una prufundità di sequenziamentu elevata, hWES facilita a rilevazione di varianti cumuni è varianti rare cù frequenze inferiori à 1%.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu cinque punti di cuntrollu principali in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteche à u sequenziamentu è a bioinformatica. Stu monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
●Analisi Bioinformatica CumpletaA nostra pipeline va oltre l'identificazione di variazioni di u genomu di riferimentu, postu chì incorpora analisi avanzate cuncepite per risponde specificamente à dumande di ricerca relative à aspetti genetichi di e malatie o analisi di tumori.
●Assistenza post-vendita:U nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
| Strategia di Cattura di l'Esoni | Strategia di Sequenziamentu | Output di dati cunsigliatu |
| Agilent SureSelectXT Umanu Tutti l'Esoni V6 + UTR + mtDNA Agilent SureSelectXT Umanu Tutti l'Esoni V6 + UTR + mtDNA (cù UMI) IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | Illumina NovaSeq PE150 | 5-10 Gb Per i disordini mendeliani/malatie rare: > 50x Per i campioni di tumore: ≥ 100x |
| Tipu di campione | Quantità(Qubit®) | Cuncentrazione | Volume | Gel d'agarosu |
| WES-FF | ≥ 150 ng | ≥ 15 ng/µL |
≥ 15 µL | Nisuna o limitata contaminazione è degradazione (a banda principale hè chjara). DNA FFPE: Se a banda principale ùn hè micca chjara, hè necessariu un strisciu distintu sopra à 2 kb. |
| WES-FFPE | ≥ 200 ng | ≥ 15 ng/µL |
L'analisi bioinformatica di i campioni di a malatia hWES include:
● QC di i dati di sequenziamentu
● Allineamentu di u Genomu di Riferimentu
● Identificazione di SNP è InDels
● Annotazione funzionale di SNP è InDels
L'analisi bioinformatica di campioni di tumore include:
● QC di i dati di sequenziamentu
● Allineamentu di u Genomu di Riferimentu
● Identificazione di SNP, InDels è variazioni somatiche
● Identificazione di varianti germinali
● Analisi di e firme di mutazione
● Identificazione di geni impulsivi basati annantu à mutazioni di guadagnu di funzione
● Annotazione di mutazione à u livellu di suscettibilità à i medicinali
● Analisi di l'eterogeneità - calculu di a purità è di a ploidia
QC di i dati - Statistiche di a cattura di l'exoma
Identificazione di variante – InDels
Analisi avanzata: identificazione è distribuzione di SNP/InDels deleteri - Graficu di Circos
Analisi di u tumore: identificazione è distribuzione di mutazioni somatiche - Diagramma di Circos
Analisi di u tumore: lignaggi clonali