Genetica Evolutiva
Vantaghji di serviziu
Takagi et al.,U ghjurnale di a pianta, 2013
●Analisi bioinformatica cumpleta:chì permette l'estimazione di a diversità genetica, chì riflette u putenziale evolutivu di e spezie, è revelà una relazione filogenetica affidabile trà e spezie cù l'influenza minima di l'evoluzione convergente è l'evoluzione parallela
●Analisi persunalizata opzionale: cum'è l'estimazione di u tempu di divergenza è a velocità basatu annantu à variazioni à u nivellu di nucleotidi è aminoacidi.
●Ampia Competenza è registri di pubblicazione: BMKGene hà accumulatu una sperienza massiva in i prughjetti di a pupulazione è di genetica evolutiva per più di 15 anni, chì copre migliaia di spezie, etc., è hà cuntribuitu à più di 1000 prughjetti d'altu livellu publicati in Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal, etc.
● Squadra di bioinformatica altamente qualificata è ciclu di analisi brevi: cù una grande sperienza in l'analisi di genomica avanzata, a squadra di BMKGene furnisce analisi cumplete cù un tempu di turnaround rapidu.
● Assistenza post-vendita:U nostru impegnu si estende oltre u cumpletu di u prughjettu cù un periodu di serviziu dopu a vendita di 3 mesi. Duranti stu tempu, offremu seguitu di u prughjettu, assistenza per a risoluzione di prublemi, è sessioni di Q&A per affruntà tutte e dumande relative à i risultati.
Specificazioni di serviziu è esigenze
| Tipu di sequenza | Scala di pupulazione cunsigliata | Strategia di sequenza | Esigenze di nucleotidi |
| Sequenza di u genoma tutale | ≥ 30 individui, cù ≥ 10 individui da ogni sottugruppu
| 10x | Concentrazione: ≥ 1 ng/µL Quantità tutale ≥ 30 ng Limitata o nulla degradazione o contaminazione |
| Fragmentu amplificatu di locu specificu (SLAF) | Profundità di tag: 10x Numaru di tag: <400 Mb: WGS hè cunsigliatu <1Gb: 100K tags 1 Gb > 2 Gb: 300K tags Max 500.000 etichette | Concentrazione ≥ 5 ng/µL Cantu tutale ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1,6-2,5 Gel d'agarose: nulla o limitata degradazione o contaminazione
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Flussu di travagliu di serviziu
Prughjettu di cuncepimentu
Consegna di mostra
Custruzzione di biblioteca
Sequencing
Analisi di dati
Servizi post-vendita
U serviziu include l'analisi di a struttura di a pupulazione (arburu filogeneticu, PCA, carta di stratificazione di a pupulazione), a diversità di a pupulazione è a selezzione di a pupulazione (disequilibrium di linkage, selezzione selettiva di spazii vantaghji). U serviziu pò ancu include analisi persunalizati (per esempiu, tempu di divergenza, flussu di geni).
*I risultati demo mostrati quì sò tutti da genomi publicati cù BMKGENE
1.L'analisi di l'evoluzione cuntene a custruzzione di l'arbulu filogeneticu, a struttura di a pupulazione è a PCA basatu nantu à variazioni genetiche.
L'arburu filogeneticu rapprisenta relazioni tassonomiche è evolutive trà e spezie cù antenati cumuni.
A PCA hà u scopu di visualizà a vicinanza trà e sub-populazioni.
A struttura di a pupulazione mostra a presenza di sub-populazione geneticamente distinta in termini di frequenze alleliche.
Chen, et. al.,PNAS, 2020
2.Spazza selettiva
Sweep selettivu si riferisce à un prucessu per quale un situ vantaghju hè sceltu è frequenze di siti neutrali ligati sò aumentati è quelli di siti unlinked sò diminuite, risultatu in a riduzzione di righjunali.
La détection à l'échelle du génome sur les régions de balayage sélectif est traitée en calculant l'indice génétique de population (π，Fst, D de Tajima) de tous les SNP dans une fenêtre glissante (100 Kb) à un certain pas (10 Kb).
Diversità di nucleotidi (π)
Tajima's D
Indice di fissazione (Fst)
Wu, et. al.,Pianta Molecular, 2018
3.Gene Flow
Wu, et. al.,Pianta Molecular, 2018
4.Storia demugrafica
Zhang, et. al.,Ecologia di a natura è Evoluzione, 2021
5.Divergenza tempu
Zhang, et. al.,Ecologia di a natura è Evoluzione, 2021
Esplora i progressi facilitati da i servizii di genetica evolutiva di BMKGene attraversu una cullizzioni curata di publicazioni:
Hassanyar, AK et al. (2023) "Discovery of SNP Molecular Markers and Candidate Genes Associated with Sacbrood Virus Resistance in Apis cerana cerana Larvae by Whole-Genome Resequencing".Rivista Internaziunale di Scienze Molekulari, 24 (7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) "A scuperta di una salamandra gigante cinese salvatica è geneticamente pura crea novi opportunità di conservazione".Ricerca Zoologica, 2022, Vol. 43, Issue 3, Pagine: 469-480, 43 (3), pp 469-480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) "Storia di l'evoluzione di a pupulazione è l'evoluzione di a pupulazione di l'Elymus sibiricus L. indigenu nantu à u Plateau Qinghai-Tibetan",Frontiere in a scienza vegetale, 13, p. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
Wang, J. et al. (2022) "Insights genomici nantu à l'evoluzione longan da un assemblea di genoma à livellu di cromusomu è genomica di pupulazioni di accessions longan",Ricerca Orticultura, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
