Genetica Evolutiva
Vantaghji di u serviziu
Takagi et al.,U ghjurnale di e piante, 2013
●Analisi bioinformatica cumpleta:permettendu a stima di a diversità genetica, chì riflette u putenziale evolutivu di e spezie, è rivelendu una relazione filogenetica affidabile trà e spezie cù l'influenza minimizzata di l'evoluzione convergente è di l'evoluzione parallela
●Analisi persunalizata facultativa: cum'è a stima di u tempu è di a velocità di divergenza basata annantu à variazioni à u livellu di i nucleotidi è di l'aminoacidi.
●Ampia cumpetenza è registri di publicazioneBMKGene hà accumulatu una sperienza massiccia in prughjetti di genetica di pupulazione è evolutiva per più di 15 anni, coprendu migliaia di spezie, ecc. è hà cuntribuitu à più di 1000 prughjetti di altu livellu publicati in Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal, ecc.
● Squadra bioinformatica altamente qualificata è ciclu d'analisi cortuCù una grande sperienza in l'analisi genomica avanzata, a squadra di BMKGene furnisce analisi cumplete cù un tempu di risposta rapidu.
● Assistenza post-vendita:U nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
Specifiche è esigenze di serviziu
| Tipu di sequenziamentu | Scala di pupulazione cunsigliata | Strategia di sequenziamentu | Requisiti di nucleotidi |
| Sequenziamentu di u Genomu Interu | ≥ 30 individui, cù ≥ 10 individui da ogni sottogruppu
| 10 volte | Cuncentrazione: ≥ 1 ng/ µL Quantità tutale ≥ 30ng Degradazione o contaminazione limitata o inesistente |
| Frammentu Amplificatu à Locu Specificu (SLAF) | Prufundità di l'etichetta: 10 volte Numeru di etichette: <400 Mb: WGS hè cunsigliatu <1Gb: 100K tag 1 Gb >2Gb: 300K etichette Massimu 500k tag | Cuncentrazione ≥ 5 ng/µL Quantità tutale ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Gel d'agarosa: nisuna o limitata degradazione o contaminazione
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Flussu di travagliu di serviziu
Cuncepimentu di l'esperimentu
Cunsegna di campioni
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
U serviziu include l'analisi di a struttura di a pupulazione (arburu filogeneticu, PCA, carta di stratificazione di a pupulazione), a diversità di a pupulazione è a selezzione di a pupulazione (disequilibriu di ligame, selezzione selettiva di siti vantaghjosi). U serviziu pò ancu include analisi persunalizate (per esempiu, tempu di divergenza, flussu geneticu).
*I risultati di a dimustrazione mostrati quì sò tutti da genomi publicati cù BMKGENE
1. L'analisi di l'evoluzione cuntene a custruzzione di l'arburu filogeneticu, a struttura di a pupulazione è l'ACP basata annantu à variazioni genetiche.
L'arburu filogeneticu rapprisenta e relazioni tassonomiche è evolutive trà e spezie cù un antenatu cumunu.
L'ACP hà per scopu di visualizà a vicinanza trà e sottopupulazioni.
A struttura di a pupulazione mostra a presenza di una sottupupulazione geneticamente distinta in termini di frequenze alleliche.
Chen, et al.,PNAS, 2020
2. Spazzata selettiva
U sweep selettivu si riferisce à un prucessu per u quale un situ vantaghjosu hè sceltu è e frequenze di i siti neutri ligati sò aumentate è quelle di i siti micca ligati sò diminuite, cù a cunsequenza di una riduzione regiunale.
A rilevazione à livellu di u genomu nantu à e regioni di scansione selettiva hè processata calculendu l'indice geneticu di a pupulazione (π, Fst, Tajima's D) di tutti i SNP in una finestra scorrevole (100 Kb) à un certu passu (10 Kb).
Diversità di nucleotidi (π)
A D di Tajima
Indice di fissazione (Fst)
Wu, et al.,Pianta moleculare, 2018
3. Flussu di geni
Wu, et al.,Pianta moleculare, 2018
4. Storia demografica
Zhang, et al.,Ecologia è Evoluzione di a Natura, 2021
5. Tempu di divergenza
Zhang, et al.,Ecologia è Evoluzione di a Natura, 2021
Esplora i progressi facilitati da i servizii di genetica evolutiva di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni:
Hassanyar, AK et al. (2023) 'Scuperta di marcatori moleculari SNP è geni candidati assuciati à a resistenza à u virus di a covata saccarifera in larve di Apis cerana cerana per mezu di u risequenziamentu di u genomu interu',Rivista internaziunale di scienze moleculari, 24 (7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) "A scuperta di una salamandra gigante cinese selvatica è geneticamente pura crea nuove opportunità di conservazione".Ricerca Zoologica, 2022, Vol. 43, Numeru 3, Pagine: 469-480, 43(3), pp. 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) 'Schema Filogeograficu è Storia di l'Evoluzione di a Pupulazione di l'Elymus sibiricus L. indigenu nantu à l'Altipianu Qinghai-Tibetano',Frontiere in Scienza Vegetale, 13, p. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
Wang, J. et al. (2022) 'Intuizioni genomiche nantu à l'evoluzione di i longani da un assemblaggio di genomi à livellu cromosomicu è genomica di pupulazione di accessioni di longani',Ricerca in Orticultura, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
