Sequenziamentu longu senza codifica - Illumina
Vantaghji di u serviziu
●Analisi cumuna di mRNA è lncRNACumbinendu a quantificazione di i trascritti di mRNA cù u studiu di l'lncRNA è di i so bersagli, hè pussibule ottene una panoramica approfondita di u mecanismu regulatoriu chì hè à a basa di a risposta cellulare.
●Una vasta cumpetenzaAvemu trattatu più di 230 000 campioni, chì abbraccianu diversi obiettivi di campioni è prughjetti. Purtemu a ricchezza di a nostra cumpetenza à ogni prughjettu.
●Analisi cumuna di mRNA è lncRNACumbinemu a quantificazione di i trascritti di mRNA cù u studiu di l'lncRNA è di i so bersagli, ciò chì permette di ottene una panoramica approfondita di u mecanismu regulatoriu chì hè à a basa di a risposta cellulare.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di i campioni à a preparazione di e biblioteche, u sequenziamentu è a bioinformatica. U nostru monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
●Annotazione cumpletaAdupremu parechje basi di dati per annotà funziunalmente i Geni Espressi Differenzialmente (DEG) è realizà analisi d'arricchimentu currispondenti. Questu approcciu cumpletu furnisce infurmazioni nantu à i prucessi cellulari è moleculari chì sò à a basa di a risposta di u trascrittoma, assicurendu chì uttene tutte l'infurmazioni pussibuli nantu à i dati di u vostru esperimentu.
●Assistenza post-venditaCapimu quantu hè impurtante esse presente, hè per quessa chì u nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
Requisiti di Campione è Cunsegna
| Biblioteca | Piattaforma | Dati cunsigliati | QC di i dati |
| Biblioteca direzionale impoverita di rRNA | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nucleotidi:
| Cunc. (ng/μl) | Quantità (μg) | Purezza | Integrità |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cuntaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazione di basa limitata o inesistente |
● Piante:
Radice, fustu o petalu: 450 mg
Foglia o Seme: 300 mg
Frutta: 1,2 g
● Animale:
Core o Intestinu: 450 mg
Viscera o Cervellu: 240 mg
Musculu: 600 mg
Ossa, Capelli o Pelle: 1,5 g
● Artropodi:
Insetti: 9g
Crustacei: 450 mg
● Sangue interu:2 tubi
● Cellule: 106 cellule
● Serumu è Plasma6 ml
Cunsegna di Campioni Raccomandata
Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 ml (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)
Etichettatura di mostra: Raggruppamentu + replicazione per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Spedizioni:
1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi RNAstabili: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di l'RNA (per esempiu, RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.
Flussu di travagliu di serviziu
Cuncepimentu di l'esperimentu
Cunsegna di campioni
Estrazione di ARN
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
Bioinformatica
- Dati grezzi
- QC di i dati
- Allineamentu di u genomu
- Struttura di i geni (splicing alternativu, ottimizazione di a struttura di i geni è nova predizione di i geni)
- Quantificazione di l'espressione genica
- Analisi di l'espressione differenziale
- Annotazione è arricchimentu DEG + Geni bersagliu lncRNA espressi differenzialmente
- Identificazione di a trascrizione
- Identificazione di lncRNA (cunservazione di lncRNA è lncRNA cunnisciutu)
- Previsione di i geni bersagliu di lncRNA
- Quantificazione di l'espressione di lncRNA
- Analisi cumuna cù dati di mRNA
Analisi di l'espressione genica differenziale (DEG)
Quantificazione di l'espressione di lncRNA - clustering
Arricchimentu di geni bersagliu lncRNA
Analisi di pusizione cumuna di l'mRNA è di lncRNA - Graficu di Circos (u cerchju mediu hè l'mRNA è u cerchju internu hè lncRNA)
Esplora i progressi facilitati da i servizii di sequenziamentu lncRNA di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Ji, H. et al. (2020) 'Identificazione, previsione funzionale è verificazione chjave di lncRNA di lncRNA ligati à u stress fretu in u fegatu di i ratti',Rapporti Scientifichi2020 10:1, 10(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'L'analisi trascrittomica integrativa rivela u mecanismu immune per una ceppa di carpa cumuna resistente à CyHV-3',Frontiere in Immunologia, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Priorizazione basata nantu à l'integrazione multi-omica di e rete di regulazione di l'ARN endogenu in cumpetizione in u cancru di u pulmone à piccule cellule: caratteristiche moleculari è candidati à i farmaci',Frontiere in Oncologia, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Dissezione genetica di a rete di coespressione genica chì sottende a fotosintesi in Populus',Rivista di Biotecnologia Vegetale, 18(4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Una rete regulatoria globale per l'espressione genica disregulata è a segnalazione metabolica anormale in e cellule immunitarie in u microambiente di a malattia di Graves è di a tiroidite di Hashimoto',Frontiere in Immunologia, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
