Carta di calore
U strumentu Heatmap accetta un schedariu di dati di matrice cum'è input è permette à l'utilizatori di filtrà, nurmalizà è raggruppà i dati. U casu d'usu principale per e carte di calore hè l'analisi di cluster di u livellu d'espressione genica trà diversi campioni.
Annotazione di u Gene
U strumentu d'annotazione di geni esegue l'annotazione di geni basata annantu à l'allineamentu di sequenze di i fugliali FASTA d'ingressu contru à diverse basi di dati.
Strumentu di Ricerca di Allineamentu Locale di Base (BLAST)
U strumentu BLAST hè una versione integrata di BMKCloud di NCBI BLAST è pò esse adupratu per eseguisce e stesse funzioni aduprendu dati caricati in u contu BMKCloud.
Previsione CDS_UTR
U strumentu di predizione CDS_UTR hè cuncipitu per predisce e regioni codificanti (CDS) è e regioni non codificanti (UTR) in sequenze di trascritti date basatu annantu à i risultati BLAST contr'à e basi di dati di proteine cunnisciute è i risultati di predizione ORF.
Trama di Manhattan
U strumentu Manhattan Plot permette a visualizazione di esperimenti à campionamentu altu è hè cumunamente utilizatu in studii d'associazione à livellu di genomu (GWAS).
Diagramma di Circu
U strumentu CIRCOS Diagram furnisce una visualizazione efficiente di cume e caratteristiche genomiche sò distribuite in tuttu u genomu. E caratteristiche cumuni includenu loci quantitativi, SNP, InDels, varianti strutturali è di numeru di copie.
Arricchimentu di l'Ontologia Genetica (GO)
U strumentu GO Enrichment furnisce analisi d'arricchimentu funzionale. U software principale in questu strumentu hè u pacchettu TopGO-Bioconductor, chì include analisi d'espressione differenziale, analisi d'arricchimentu GO è visualizazione di i risultati.
Analisi di a Rete di Coespressione Genica Ponderata (WGCNA)
WGCNA hè un metudu di data mining largamente utilizatu per scopre moduli di coespressione genica. Hè applicabile à diversi datasets d'espressione, cumpresi i dati d'espressione genica di microarray è NGS.
InterProScan
U strumentu InterProScan furnisce l'analisi è a classificazione di a sequenza di proteine InterPro.
Arricchimentu GO KEGG
U strumentu d'arricchimentu GO KEGG hè cuncipitu per generà un istogramma d'arricchimentu GO, un istogramma d'arricchimentu KEGG è una via d'arricchimentu KEGG basata annantu à un inseme di geni furnitu è l'annotazione currispundente.