Heatmap
U schedariu di dati Matrix hè utilizatu per u disegnu di a mappa di calore, chì pò filtrà, nurmalizà è raggruppa i dati di a matrice.Hè soprattuttu utilizatu per l'analisi di cluster di u livellu di l'espressione genica trà diversi campioni.
Annotazione genica
L'annotazione di a funzione genica hè realizata da sequenze di mappatura in u schedariu FASTA contr'à diverse basa di dati.
Annotazione genica
Strumentu di ricerca di allineamentu lucale di basa
CDS_UTR_Predizione
Stu strumentu hè pensatu per predichendu regioni codificanti (CDS) è regioni non codificanti (UTR) in sequenze di trascrizione date basate su blasting contr'à a basa di dati di proteina cunnisciuta è a prediczione ORF.
Trama di Manhattan
A trama di Manhattan permette a visualizazione di dati cù un gran numaru di punti di dati.Hè comunmente utilizatu in studii d'associazione genome-wide (GWAS).
Circhi
U diagramma CIRCOS permette a presentazione diretta di distribuzioni SNP, InDeL, SV, CNV nantu à u genoma.
GO_Enrichment
TopGO hè un strumentu pensatu per l'arricchimentu funziunale.U pacchettu TopGO-Bioconductor cunsiste l'analisi di espressione differenziale, l'analisi di arricchimentu GO è a visualizazione di i risultati.Generarà un cartulare cù output chjamatu "Graph", chì cuntene risultati per topGO_BP, topGO_CC è topGO_MF.
WGCNA
WGCNA hè un metudu di data mining largamente utilizatu per scopre i moduli di co-espressione genica.Hè applicabile à varii dataset di espressione cumprese dati di microarray è dati di espressione genica originati da a sequenza di a prossima generazione.
InterProScan
Analisi di sequenza di proteine InterPro è classificazione
GO_KEGG_Enrichment
Stu strumentu hè cuncepitu per generà l'istogramma di arricchimentu GO, l'istogramma di arricchimentu KEGG è u percorsu di arricchimentu KEGG basatu annantu à u set di geni furnitu è l'annotazione currispondente.