mRNA-seq (NGS) cù genomu di riferimentu
RNA-seq hè un strumentu standard in e scienze di a vita è di e culture, chì colma u fossu trà i genomi è i proteomi. A so forza stà in a scuperta di novi trascritti è a quantificazione di a so espressione in un solu test. Hè largamente utilizatu per studii trascrittomichi cumparativi, chì mettenu in luce i geni ligati à vari tratti o fenotipi, cum'è paragunà i mutanti à i tipi salvatichi o rivelà l'espressione genica in cundizioni specifiche. L'APP BMKCloud mRNA (Reference) integra a quantificazione di l'espressione, l'analisi di l'espressione differenziale (DEG) è l'analisi di a struttura di sequenza in a pipeline bioinformatica mRNA-seq (NGS) è amalgama i punti di forza di software simili, assicurendu a cunvenienza è a facilità d'usu. L'utilizatori ponu caricà i so dati RNA-seq in u cloud, induve l'App offre una suluzione cumpleta d'analisi bioinformatica one-stop. Inoltre, dà priorità à l'esperienza di u cliente, offrendu operazioni persunalizate adattate à i bisogni specifichi di l'utilizatori. L'utilizatori ponu impostà parametri è invià a missione di a pipeline da soli, verificà u rapportu interattivu, vede dati / diagrammi è cumpletà l'estrazione di dati, cum'è: selezzione di geni target, clustering funzionale, diagrammi, ecc.


Piattaforma:Illumina, MGI
Strategia:RNA-Seq
Disposizione: Paried, dati puliti.
Tipu di biblioteca:fr-senza filamenti, fr-primu filamentu o fr-secondu filamentu
Lunghezza di lettura:150 bp
Tipu di schedariu:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz o *.fq.gz. U sistemaaccoppia automaticamente i fugliali .fastq secondu i so nomi di fugliali,per esempiu *_1.fastq assuciatu cù *._2.fastq.
Numeru di campioni:Ùn ci sò micca restrizioni nantu à u numerudi campioni, ma u tempu d'analisi aumenterà cù u numeru dii campioni crescenu.
Quantità di dati cunsigliata:6G per campione