Sequenziamentu di u Trascrittoma Interu - Illumina
Funziunalità
● Generazione di doppia biblioteca per sequenzià u trascrittoma cumpletu: biblioteca di deplezione di rRNA è preparazione di piccule biblioteche di RNA.
● Analisi bioinformatica cumpleta di mRNA, lncRNA, circRNA è miRNA in rapporti bioinformatici separati, più un'analisi cumuna cù tutte l'espressioni di RNA cumminate, cumprese l'analisi di e rete ceRNA.
Vantaghji di u serviziu
●Una vasta cumpetenzaAvemu trattatu più di 2100 prughjetti di trascrittoma cumpleti, chì abbraccianu diversi tipi di campioni. Purtemu a ricchezza di a nostra cumpetenza à ogni prughjettu.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di i campioni à a preparazione di e biblioteche, u sequenziamentu è a bioinformatica. U nostru monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
●Annotazione cumpletaAdupremu parechje basi di dati per annotà funziunalmente i Geni Espressi Differenzialmente (DEG) è realizà analisi d'arricchimentu currispondenti. Questu approcciu cumpletu furnisce infurmazioni nantu à i prucessi cellulari è moleculari chì sò à a basa di a risposta di u trascrittoma, assicurendu chì uttene tutte l'infurmazioni pussibuli nantu à i dati di u vostru esperimentu.
●Analisi approfondita di e rete regulatorieL'analisi di a rete ceRNA hè permessa da u sequenziamentu cumunu di mRNA, lncRNA, circRNA è miRNA è da un flussu di travagliu bioinformaticu cumpletu.
●Assistenza post-venditaCapimu quantu hè impurtante esse presente, hè per quessa chì u nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
Requisiti di Campione è Cunsegna
| Biblioteca | Strategia di sequenziamentu | Dati cunsigliati | Cuntrollu di qualità |
| rRNA svuotatu | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Taglia selezziunata | Illumina SE50 | 10-20 milioni di letture |
Requisiti di u campione:
Nucleotidi:
| Cunc. (ng/μl) | Quantità (μg) | Purezza | Integrità |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cuntaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazione di basa limitata o inesistente |
Cunsegna di Campioni Raccomandata
Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 ml (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)
Etichettatura di mostra: Raggruppamentu + replicazione per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Spedizioni:
1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi RNAstabili: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di RNA (per esempiu RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.
Flussu di travagliu di serviziu
Cuncepimentu di l'esperimentu
Cunsegna di campioni
Estrazione di ARN
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
Bioinformatica
In più di tutte l'analisi di ogni differente, i 4 tipi d'ARN sò cumminati in a nostra analisi cumuna:
- Analisi di coespressione trà tutti i diversi tipi di dati di RNA
- Panoramica di l'espressione di l'ARN
- Panoramica di l'espressione differenziale
- Rete CeRNA
- Geni chjave integrati in a via
- Analisi di cunservazione
- Relazioni di mira
Panoramica di l'espressione di l'ARN
Geni espressi in modu differenziale
analisi di ceRNA
miRNA espressi in modu differenziale è RNA correlati
Esplora i progressi di a ricerca facilitati da i servizii di sequenziamentu di u trascrittoma cumpletu di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Dai, Y. et al. (2022) 'Profili d'espressione cumpleti di mRNA, lncRNA è miRNA in a malatia di Kashin-Beck identificati da u sequenziamentu di l'RNA',Omica Moleculare, 18 (2), pp. 154-166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) 'Analisi di i trascrittomi cumpleti di a resistenza à u fretu di Apis cerana in Changbai Mountain durante u periodu di svernamentu.'Gene, 830, pp. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Priorizazione basata nantu à l'integrazione multi-omica di e rete di regulazione di l'ARN endogenu in cumpetizione in u cancru di u pulmone à piccule cellule: caratteristiche moleculari è candidati à i farmaci',Frontiere in Oncologia, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) 'L'analisi integrata di i profili d'espressione lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA rivela nuove intuizioni nantu à i potenziali meccanismi in risposta à i nematodi a nodi radicali in l'arachidi',BMC Genomics, 23(1), pp. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'U sequenziamentu di l'ARN di u trascrittoma cumpletu mette in risaltu i meccanismi moleculari assuciati à u mantenimentu di a qualità post-raccolta in i broccoli per irradiazione LED rossa',Biologia è Tecnulugia Post-raccolta, 188, p. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
