● Doppia libreria per sequenza di u transcriptome cumpletu: deplezione di rRNA seguita da preparazione di libreria PE150 è selezzione di taglia seguita da preparazione di libreria SE50
● Analisi bioinformatica cumpleta di mRNA, lncRNA, circRNA è miRNA in rapporti bioinformatici separati
● Analisi cumuna di tutte l'espressioni di RNA in un rapportu cumminatu, cumprese l'analisi di e rete ceRNA.
●Analisi approfondita di i Reti Regulatori: l'analisi di a rete di ceRNA hè attivata da a sequenza cumuna di mRNA, lncRNA, circRNA è miRNA è da un flussu di travagliu bioinformaticu exhaustu.
●Annotation Comprehensive: Utilizemu parechje basa di dati per annotà funziunalmente i Genes Differentially Expressed (DEG) è eseguite l'analisi di arricchimentu currispundenti, chì furnisce una visione di i prucessi cellulari è moleculari sottumessi à a risposta di u transcriptome.
●Vasta Competenza: Cù una storia di chjude cù successu più di 2100 prughjetti di transcriptome interi in diversi domini di ricerca, a nostra squadra porta una ricchezza di sperienza à ogni prughjettu.
●Rigurosu cuntrollu di qualità: Implementemu punti di cuntrollu di core in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteca à a sequenza è a bioinformatica. Stu surviglianza meticulosa assicura a consegna di risultati sempre di alta qualità.
●Assistenza post-vendita: U nostru impegnu si estende oltre u cumpletu di u prugettu cù un periodu di serviziu dopu a vendita di 3 mesi. Duranti stu tempu, offremu seguitu di u prughjettu, assistenza per a risoluzione di prublemi, è sessioni di Q&A per affruntà tutte e dumande relative à i risultati.
Biblioteca | Strategia di sequenza | Dati cunsigliatu | Controlu di qualità |
l'ARNr appauvri | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
Taglia scelta | Illumina SE50 | 10-20 milioni di leghje |
Nucleotidi:
Conc. (ng/μl) | Quantità (μg) | Purità | Integrità |
≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Cuntaminazione limitata o micca di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | RIN≥6,0 5.0≥28S/18S≥1.0; limitazione o senza elevazione di basa |
Contenitore: Tubu da centrifuga da 2 ml (Un fogliu di stagno ùn hè micca cunsigliatu)
Esempiu di etichettatura: Gruppu + replicate per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.
spedizione:
1. Ghiaccio seccu: I campioni deve esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi RNAstable: i campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di RNA (per esempiu RNAstable®) è spedite à a temperatura di l'ambienti.
Bioinformatica
Panoramica di l'espressione di RNA
Geni espressi di manera differenziale
analisi ceRNA
Esplora l'avanzamenti di ricerca facilitati da i servizii di sequenza di trascrittomi interi di BMKGene attraversu una cullizzioni curata di publicazioni.
Dai, Y. et al. (2022) "Profili di espressione cumpleta di mRNAs, lncRNAs è miRNAs in a malatia di Kashin-Beck identificata da RNA-sequencing", Molecular Omics, 18 (2), pp. 154-166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) "Analisi di transcriptomes full length of cold-resistance of Apis cerana in Changbai Mountain during overwintering period.', Gene, 830, pp. 146503-146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Priorità basata in l'integrazione multi-omica di e rete di regulazione di l'RNA endogenu cumpetitivi in u Cancer di Pulmone di Cellule Piccole: Caratteristiche Moleculari è Candidati di Drug', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) "L'analisi integrata di l'espressione di lncRNA / circRNA-miRNA-mRNA palesa novi insights in i miccanismi putenziali in risposta à i nematodi di a radica in l'arachide", BMC Genomics, 23 (1), pp. 1-12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al. (2022) "A sequenza di l'RNA di u transcriptome interu mette in risaltu i meccanismi molecolari assuciati à u mantenimentu di a qualità post-raccolta in u broccoli da l'irradiazione LED rossa", Postharvest Biology and Technology, 188, p. 111878. doi : 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.