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I prudutti

Sequenza di mRNA basata senza riferenza-NGS

A sequenza di mRNA permette a profilazione cumpleta di tutte e trascrizioni di mRNA in e cellule in cundizioni specifiche. Sta tecnulugia d'avanguardia serve cum'è un strumentu putente, svelendu profili intricati di espressione genica, strutture genetiche è meccanismi molecolari assuciati à diversi prucessi biologichi. Ampiamente aduttatu in a ricerca fundamentale, a diagnostica clinica è u sviluppu di droghe, a sequenza di mRNA offre una visione di e intricacies di a dinamica cellulare è a regulazione genetica.

Piattaforma: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7


Dettagli di serviziu

Bioinformatica

Risultati Demo

Publicazioni Featured

Features

● Capture di poly mRNA prima di preparazione di biblioteca

● Indipendente di ogni genoma di riferimentu: basatu annantu à l'assemblea de novo di trascrizioni, generendu una lista di unigeni chì sò annotati cù parechje basa di dati (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)

● Analisi bioinformatica cumpleta di l'espressione genica è a struttura di trascrizione

Vantaghji di serviziu

Vasta Competenza: cù una storia di trasfurmazioni di più di 600.000 campioni in BMKGENE, chì copre diversi tipi di campioni cum'è culturi di cellule, tessuti è fluidi di u corpu, a nostra squadra porta una ricchezza di sperienza à ogni prughjettu. Avemu chjusu cù successu più di 100 000 prughjetti mRNA-Seq in diversi domini di ricerca.

Rigurosu cuntrollu di qualità: implementemu punti di cuntrollu di core in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteca à a sequenza è a bioinformatica. Stu surviglianza meticulosa assicura a consegna di risultati sempre di alta qualità.

● Annotation Comprehensive: usemu parechje basa di dati per annotà funziunalmente i Genes Differentially Expressed (DEGs) è eseguite l'analisi di arricchimentu currispundenti, furnisce insights nantu à i prucessi cellulari è moleculari sottumessi à a risposta transcriptome.

Assistenza post-vendita: u nostru impegnu si estende oltre u cumpletu di u prugettu cù un periodu di serviziu dopu a vendita di 3 mesi. Duranti stu tempu, offremu seguitu di u prughjettu, assistenza per a risoluzione di prublemi, è sessioni di Q&A per affruntà tutte e dumande relative à i risultati.

Requisiti di mostra è consegna

Biblioteca

Strategia di sequenza

Dati cunsigliatu

Controlu di qualità

Poly A arricchitu

Illumina PE150

DNBSEQ-T7

6-10 Gb

Q30≥85%

Requisiti di mostra:

Nucleotidi:

Conc. (ng/μl)

Quantità (μg)

Purità

Integrità

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280 = 1,7-2,5

OD260/230 = 0,5-2,5

Cuntaminazione limitata o micca di proteine ​​​​o DNA mostrata nantu à u gel.

Per i pianti: RIN≥4.0;

Per l'animali: RIN≥4.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

limitazione o senza elevazione di basa

● Piante :

Radice, Stem o Petali: 450 mg

Foglia o Semente: 300 mg

Frutta: 1,2 g

● Animali :

Cuore o intestinu: 300 mg

Viscera o Cervellu: 240 mg

Musculu: 450 mg

Osse, capelli o pelle: 1 g

● Artropodi :

Insetti: 6 g

Crustacea: 300 mg

● Sangue sanu: 1 tubu

● Cellule : 106 cellule

Cunsigliu Cunsigliu di Campione

Contenitore: Tubu da centrifuga da 2 ml (Un fogliu di stagno ùn hè micca cunsigliatu)

Esempiu di etichettatura: Gruppu + replicate per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.

spedizione:

1. Ghiaccio seccu: I campioni deve esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.

2. Tubi RNAstable: i campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di RNA (per esempiu, RNAstable®) è spedite in a temperatura di l'ambienti.

Flussu di travagliu di serviziu

Esempiu QC

Prughjettu di cuncepimentu

consegna di mostra

Consegna di mostra

Esperimentu pilotu

estrazione di RNA

Preparazione di a biblioteca

Custruzzione di biblioteca

Sequencing

Sequencing

Analisi di dati

Analisi di dati

Servizii dopu a vendita

Servizi post-vendita


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    Assemblea di transcriptome è selezzione unigene

     

    图片6

     

     

     annotazione Unigene

    图片7 

     

    Correlazione di campioni è valutazione di replicati biologichi

     

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    Genes espressi di manera differenziale (DEG)

     

     图片9

     

     

    Annotazione Funzionale di DEG

     

    图片10

     

    Arricchimentu Funziunale di DEG

     

    图片11

    Esplora i progressi facilitati da i servizii di sequenza di mRNA NGS eucarioti di BMKGene attraversu una cullizzioni curata di publicazioni.

     

    Shen, F. et al. (2020) "Assemblea di transcriptome de novo è espressione di gene biased sessu in i gonadi di Amur catfish (Silurus asotus)", Genomica, 112 (3), pp. 2603-2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.

    Zhang, C. et al. (2016) "Analisi di transcriptome di u metabolismu di saccarosi durante l'inflazione di u bulbe è u sviluppu in a cipolla (Allium cepa L.)", Frontiers in Plant Science, 7 (settembre), p. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.

    Zhu, C. et al. (2017) "Assembly De novo, caratterizzazione è annotazione per u transcriptome di Sarcocheilichthys sinensis", PLoS ONE, 12 (2). doi : 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.

    Zou, L. et al. (2021) "L'analisi di transcriptome De novo furnisce insights in a tolleranza di u sali di Podocarpus macrophyllus sottu u stress di salinità", BMC Plant Biology, 21 (1), pp. 1-17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.

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