Analisi di l'ARNm eucarioticu (opzioni basate nantu à riferimenti è de novo dispunibili)
Questa pipeline usa i dati NGS RNA-Seq cum'è input è produce risultati da parechje analisi à valle, cumprese, ma senza limitazione à: valutazione di a qualità di i dati di sequenziamentu,di novuannotazione di u situ di trascrizione, analisi di splicing variabile, analisi di l'espressione differenziale, annotazione di funzione è analisi di arricchimentu.
Analisi di RNA longu non codificante
L'ARN longhi non codificanti (lncRNA) sò trascritti non codificanti cù lunghezze superiori à 200 nt è cunnisciuti per ghjucà roli in l'urganizazione è a regulazione di a cromatina. E tecnulugie di sequenziamentu à altu rendimentu è a bioinformatica anu permessu a nostra comprensione di e sequenze di lncRNA è di l'infurmazioni di pusizionamentu per identificà lncRNA cù funzioni regulatorie cruciali. Questa pipeline furnisce analisi di lncRNA in più di l'analisi menzionate in a pipeline di analisi di l'mRNA eucarioticu.
Sequenziamentu di ampliconi 16S/18S/ITS
A pipeline d'analisi di a diversità microbica di Amplicon Sequencing hè stata sviluppata basendu si nantu à anni di sperienza in l'analisi di prughjetti di diversità microbica. A pipeline cuntene analisi basiche standardizate, chì copre u cuntenutu d'analisi principale di a ricerca microbica attuale è l'analisi persunalizata. U rapportu d'analisi hè riccu è cumpletu, cù l'opzione di realizà analisi persunalizate diverse. Inoltre, i campioni è i gruppi ponu esse mudificati in tempu reale per una persunalizazione è un cuntrollu supplementari.
Analisi Metagenomica di u Fucile à Pistola
A pipeline di Shotgun Metagenomic Analysis usa dati NGS da materiali genomici misti estratti da campioni ambientali. L'analisi incluse furniscenu informazioni dettagliate nantu à a diversità è l'abbundanza di e spezie, a struttura di a pupulazione, a relazione filogenetica, i geni funziunali è e rete di currelazione cù i fattori ambientali.
Analisi di e Varianti NGS-WGS
L'Analisi di Varianti NGS-WGS hè una pipeline integrata di rilevazione di varianti chì esegue u cuntrollu di a qualità di i dati, l'allineamentu di sequenze, l'annotazione è l'analisi di mutazioni genetiche. A pipeline seguita e migliori pratiche GATK per a rilevazione di SNP è InDel è usa Manta per a chjama di varianti strutturali.
Studiu di Associazione à u Genomu Interu (GWAS)
A pipeline GWAS hè un'analisi downstream chì piglia cum'è input i fugliali VCF generati in precedenza è i dati fenotipichi currispondenti per una coorte d'individui. Usendu metodologie statistiche specifiche, GWAS hà per scopu di scopre variazioni di nucleotidi à livellu di u genomu correlate cù differenze fenotipiche. Ghjoca un rolu cruciale in l'esplorazione di geni funziunali assuciati à malatie umane cumplesse è tratti intricati in piante è animali.
Analisi di Segregazione in Massa (BSA)
L'analisi BSA implica u raggruppamentu di individui cù tratti fenotipici estremi da una pupulazione segregata. Paragunendu i loci differenziali trà i campioni raggruppati, questu approcciu identifica rapidamente i marcatori moleculari strettamente ligati assuciati à i geni bersagliu. Ampiamente utilizatu in a cartografia genetica di piante è animali, hè un strumentu preziosu per a ripruduzzione assistita da marcatori.
Analisi Genetica Evolutiva
U flussu di travagliu di l'Analisi Genetica Evolutiva sfrutta a vasta esperienza di BMKGENE in i prughjetti di evoluzione genetica è include a custruzzione di l'arburi filogenetici, l'analisi di u disequilibriu di ligamentu, a valutazione di a diversità genetica, l'identificazione di u sweep selettivu, l'analisi di parentela, l'analisi di i cumpunenti principali è a caratterizazione di a struttura di a pupulazione.
