Sequenziamentu CircRNA-Illumina
Funziunalità
● Deplezione di rRNA seguita da preparazione di a biblioteca direzionale, chì permette dati di sequenziamentu specifichi di u filamentu.
● U flussu di travagliu bioinformaticu permette a predizione di circRNA è a quantificazione di l'espressione.
Vantaghji di u serviziu
●Una vasta cumpetenzaAvemu trattatu più di 20 000 campioni, chì abbraccianu diversi tipi di campioni, purtemu a ricchezza di a nostra cumpetenza à ogni prughjettu.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di i campioni à a preparazione di e biblioteche, u sequenziamentu è a bioinformatica. U nostru monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
●Biblioteche di RNA più cumplete:Adupremu a deplezione di rRNA invece di a deplezione di RNA lineare in a nostra preparazione pre-biblioteca, assicurendu chì i dati di sequenziamentu includenu micca solu circRNA ma ancu mRNA è lncRNA, permettendu l'analisi cumuna di sti insemi di dati.
●Analisi Opzionale di Reti di RNA Endogeni Competitivi (ceRNA)Furnisce una visione più approfondita di i meccanismi di regulazione cellulare.
● Assistenza post-venditaCapimu quantu hè impurtante esse presente, hè per quessa chì u nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
Requisiti di Campione è Cunsegna
| Biblioteca | Piattaforma | Dati cunsigliati | QC di i dati |
| Biblioteca direzionale impoverita di rRNA | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Requisiti di u campione:
Nucleotidi:
| Cunc. (ng/μl) | Quantità (μg) | Purezza | Integrità |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cuntaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazione di basa limitata o inesistente |
● Piante:
Radice, fustu o petalu: 450 mg
Foglia o Seme: 300 mg
Frutta: 1,2 g
● Animale:
Core o Intestinu: 450 mg
Viscera o Cervellu: 240 mg
Musculu: 600 mg
Ossa, Capelli o Pelle: 1,5 g
● Artropodi:
Insetti: 9g
Crustacei: 450 mg
● Sangue interu:2 tubi
● Cellule: 106 cellule
● Serumu è Plasma6 ml
Cunsegna di Campioni Raccomandata
Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 ml (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)
Etichettatura di mostra: Raggruppamentu + replicazione per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Spedizioni:
1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi RNAstabili: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di l'RNA (per esempiu, RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.
Flussu di travagliu di serviziu
Cuncepimentu di l'esperimentu
Cunsegna di campioni
Estrazione di ARN
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
Bioinformatica
- QC di i dati
- Allineamentu di u genomu
- Identificazione di CircRNA
- Espressione di CircRNA
- Analisi di l'espressione differenziale
Previsione di circRNA: distribuzione cromosomica
CircRNA espressi in modu differenziale - Graficu di u vulcanu
CircRNA espressi in modu differenziale - raggruppamentu gerarchicu
Arricchimentu funzionale di i geni ospiti di circRNA
Esplora i progressi di a ricerca facilitati da i servizii di sequenziamentu circRNA di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 regula a furmazione di circRNA è u silenziamentu geneticu mediatu da microRNA in u carcinoma epatocellulare',Oncogene2021 40:25, 40(25), pp. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'U trascrittoma X oo-responsive rivela u rolu di l'RNA133 circulare in a resistenza à e malatie regulendu l'espressione di OsARAB in u risu',Ricerca in Fitopatologia, 5(1), pp. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 modula l'equilibriu di i trascritti circulari è lineari in u carcinoma epatocellulare'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Valutazione cumpleta di i circRNA in a cardiomiopatia cirrotica prima è dopu u trapianto di fegatu',Immunofarmacologia Internaziunale, 114, p. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
