circRNA sequencing-Illumina
Features
● Depletion di rRNA seguita da a preparazione di a libreria direzionale, chì permette a dati di sequenza chì hè specificu per i filamenti.
● U flussu di travagliu bioinformaticu permette a prediczione di circRNA è a quantificazione di l'espressione
Vantaghji di serviziu
●Biblioteche RNA più complete:usemu a deplezione di rRNA invece di a deplezione di RNA lineale in a nostra preparazione pre-biblioteca, assicurendu chì i dati di sequenza includenu micca solu circRNA, ma ancu mRNA è lncRNA, chì permettenu l'analisi cumuna nantu à questi datasets.
●Analisi opzionale di rete di RNA endogenu cumpetitivu (ceRNA).: furnisce una visione più profonda di i meccanismi di regulazione cellulare
●Vasta Competenza: cù una storia di trasfurmazioni di più di 20,000 campioni in BMK, chì copre diversi tipi di campioni è prughjetti lncRNA, a nostra squadra porta una ricchezza di sperienza à ogni prughjettu.
●Rigurosu cuntrollu di qualità: implementemu punti di cuntrollu di core in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteca à a sequenza è a bioinformatica.Stu surviglianza meticulosa assicura a consegna di risultati sempre di alta qualità.
● Support post-vendita: U nostru impegnu si estende oltre u cumpletu di u prugettu cù un periodu di serviziu dopu a vendita di 3 mesi.Duranti stu tempu, offremu seguitu di u prughjettu, assistenza per a risoluzione di prublemi, è sessioni di Q&A per affruntà tutte e dumande relative à i risultati.
Requisiti di mostra è consegna
| Biblioteca | Piattaforma | Dati cunsigliatu | Dati QC |
| Poly A arricchitu | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Requisiti di mostra:
Nucleotidi:
| Conc. (ng/μl) | Quantità (μg) | Purità | Integrità |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Cuntaminazione limitata o micca di proteine o DNA mostrata nantu à u gel. | Per i pianti: RIN≥6.5; Per l'animali: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitazione o senza elevazione di basa |
● Piante :
Radice, Stem o Petali: 450 mg
Foglia o Semente: 300 mg
Frutta: 1,2 g
● Animali :
Cuore o intestinu: 450 mg
Viscera o Cervellu: 240 mg
Musculu: 600 mg
Ossa, capelli o pelle: 1,5 g
● Artropodi :
Insetti: 9 g
Crustacea: 450 mg
● Sangue sanu :2 tubi
● Cellule : 106 cellule
● Serum è Plasma: 6 ml
Cunsigliu Cunsigliu di Campione
Contenitore: Tubu da centrifuga da 2 ml (Un fogliu di stagno ùn hè micca cunsigliatu)
Esempiu di etichettatura: Gruppu + replicate per esempiu A1, A2, A3;B1, B2, B3....
spedizione:
1. Ghiaccio seccu: I campioni deve esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi RNAstable: i campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di RNA (per esempiu, RNAstable®) è spedite in a temperatura di l'ambienti.
Flussu di travagliu di serviziu
Prughjettu di cuncepimentu
Consegna di mostra
estrazione di RNA
Custruzzione di biblioteca
Sequencing
Analisi di dati
Servizi post-vendita
Bioinformatica
Predizione di circRNA: distribuzione cromusomica
CirRNA espressi di manera differenziale - Trama di u vulcano
circRNAs Differentially Expressed - clustering gerarchicu
Arricchimentu funzionale di i geni di l'ospiti di circRNA
Esplora l'avanzamenti di ricerca facilitati da i servizii di sequenza di circRNA di BMKGene attraversu una cullizzioni curata di publicazioni.
Wang, X. et al.(2021) "CPSF4 regula a furmazione di circRNA è u silenziu di u gene mediatu da microRNA in u carcinoma hepatocellular", Oncogene 2021 40: 25, 40 (25), pp. 4338-4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al.(2023) "X oo-responsive transcriptome palesa u rolu di l'RNA133 circular in a resistenza à e malatie regulendu l'espressione di OsARAB in u risu", Phytopathology Research, 5 (1), pp 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al.(2023) "CPSF3 modula l'equilibriu di trascrizioni circulari è lineari in u carcinoma hepatocellular".doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) "Evaluazione cumpleta di circRNAs in cardiomiopatia cirrhotic prima è dopu u trasplante di fegatu", International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
