Biblioteche predefinite di Illumina
Funziunalità
●Piattaforme:Illumina NovaSeq 6000 è NovaSeq X Plus
●Modi di sequenziamentu:PE150 è PE250
●Cuntrollu di qualità di e biblioteche prima di u sequenziamentu
●Sequenziamentu di dati QC è consegna:consegna di u rapportu QC è di i dati grezzi in furmatu fastq dopu à a demultiplexazione è u filtraggio di e letture Q30
Vantaghji di u serviziu
●Versatilità di i servizii di sequenziamentu:U cliente pò sceglie di sequenzià per corsia, cella di flussu, o per quantità di dati richiesti (sequenziamentu parziale di corsia).
●Vasta sperienza nantu à a piattaforma di sequenziamentu Illumina:cù millaie di prughjetti chjusi cù diverse spezie.
●Cunsegna di u rapportu QC di sequenziamentu:cù metriche di qualità, accuratezza di i dati è rendimentu generale di u prughjettu di sequenziamentu.
●Prucessu di sequenziamentu maturu:cù un tempu di ripresa cortu.
●Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu requisiti di QC rigorosi per guarantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.
Piattaforme di Campione
| Piattaforma | Cella di flussu | Modu di sequenziamentu | Unità | Pruduzzione stimata |
| NovaSeq X | 10B (8 corsie) | PE150 | Corsia unica Corsia parziale | 375 Gb / Corsia |
| 25B (8 corsie) | PE150 | Corsia unica Corsia parziale | 1000 Gb/Corsia | |
| NovaSeq 6000 | Cella di flussu SP (2 corsie) | PE250 | Cella di flussu Corsia unica Corsia parziale | 325-400 M letture / Corsia |
| Cellula di flussu S4 (4 corsie) | PE150 | Cella di flussu Corsia unica Corsia parziale | ~800 Gb / Corsia |
Requisiti di Campione
| Quantità di dati (X) | Cuncentrazione (qPCR/nM) | Volume | |
| Sequenziamentu Parziale di Corsia
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Sequenza di corsia | Per Corsia | ≥ 1,5 nM / Raggruppamentu di librerie | ≥ 25 μl / Raggruppamentu di a biblioteca |
In più di a cuncentrazione è di a quantità tutale, hè necessariu ancu un mudellu di piccu adattatu.
Nota: U sequenziamentu di corsie di biblioteche à bassa diversità richiede u spike-in PhiX per assicurà una chjama di basa robusta.
Ricumandemu di mandà biblioteche pre-raggruppate cum'è campioni. Sè avete bisognu di BMKGENE per eseguisce u raggruppamentu di biblioteche, per piacè riferitevi à
i requisiti di a biblioteca per u sequenziamentu parziale di corsie.
Dimensione di a biblioteca (Carta di punta)
U piccu principale deve esse trà 300-450 bp.
E biblioteche devenu avè un unicu piccu principale, nisuna contaminazione di l'adattatore è nisun dimeru di primer.
Per piacè cuntattateci se i vostri campioni ùn rispondenu micca à i requisiti di u materiale di partenza.
Flussu di travagliu di serviziu
Cuntrollu di qualità di a biblioteca
Sequenziamentu
Cuntrollu di a qualità di i dati
Cunsegna di u prugettu
Rapportu di qualità di u cuntrollu di a biblioteca
Un rapportu nantu à a qualità di a biblioteca hè furnitu prima di u sequenziamentu, valutendu a quantità di a biblioteca è a frammentazione.
Rapportu QC di sequenziamentu
Tavula 1. Statistiche nantu à i dati di sequenziamentu.
| ID di campione | BMKID | Letture crude | Dati grezzi (bp) | Letture pulite (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzione di a qualità longu e letture in ogni campione
Figura 2. Distribuzione di u cuntenutu di basa
Figura 3. Distribuzione di u cuntenutu lettu in i dati di sequenziamentu
