Sequenziamentu di Bisulfiti à Rappresentazione Ridotta (RRBS)
U sequenziamentu à ridutta rapprisentazione di bisulfitu (RRBS) si basa nantu à l'arricchimentu di e regioni ricche di l'isule CpG per via di a scissione di MspI seguita da a selezzione di a dimensione di frammenti di 200-500/600 bps. Di cunsiguenza, solu e regioni prossimali à l'isule CpG sò sequenziate, mentre chì quelle cù isule CpG distanti sò escluse da l'analisi. Stu prucessu, cumminatu cù u sequenziamentu di bisulfitu, permette una rilevazione à alta risoluzione di a metilazione di u DNA, è l'approcciu di sequenziamentu, PE150, si concentra specificamente nantu à l'estremità di l'inserti piuttostu chè nantu à u mezu, aumentendu l'efficienza di a prufilazione di metilazione.
Sta tecnica hè diventata un'alternativa efficace è à bon pattu à u Sequenziamentu di u Bisulfitu di u Genomu Interu (WGBS) in a ricerca di metilazione di u DNA. Mentre u WGBS furnisce insights cumpleti esaminendu u genomu interu à una risoluzione di basa unica, u so costu elevatu pò esse un fattore limitante, chì u RRBS mitiga strategicamente sta sfida analizendu selettivamente una parte rappresentativa di u genomu. Sta metodologia hè un strumentu preziosu chì permette una ricerca efficace in termini di costi nantu à a metilazione di u DNA è avanza a cunniscenza di i meccanismi epigenetici.
Funzioni di serviziu
● Sequenziamentu nantu à Illumina NovaSeq.
● Richiede un genomu di riferimentu.
● L'ADN Lambda hè adupratu per monitorà l'efficienza di cunversione di bisulfitu.
● L'efficienza di digestione di MspI hè ancu monitorata.
● Digestione à doppia enzima per campioni di piante.
Vantaghji di u serviziu
●Alternativa à bon pattu è efficiente à u WGBSPermette di fà l'analisi à un costu più bassu è cù esigenze di campione più basse.
●Piattaforma cumpleta:Offremu un serviziu eccellente unicu, da u trattamentu di campioni, a custruzione di biblioteche è u sequenziamentu à l'analisi bioinformatica.
●Una vasta cumpetenzaAvemu successu in una vasta gamma di spezie. BMKGENE porta più di una decina d'anni di sperienza, una squadra d'analisi altamente qualificata, un cuntenutu cumpletu è un eccellente supportu post-vendita.
Specifiche di serviziu
| Biblioteca | Strategia di Sequenziamentu | Output di dati cunsigliatu | cuntrollu di qualità |
| Libreria digerita cù MspI è trattata cù bisulfitu | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Cunversione di bisulfitu > 99% Efficienza di taglio MspI > 95% |
Requisiti di Campione
| Cuncentrazione (ng/µL) | Quantità tutale (µg) |
| |
| ADN genomicu | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradazione o contaminazione limitata |
Flussu di travagliu di serviziu
Cunsegna di campioni
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
L'analisi BI include:
● Cuntrollu di qualità di u sequenziamentu crudu;
● Mappatura à u genomu di riferimentu;
● Rilevazione di basi metilate 5mC è identificazione di motivi;
● Analisi di a distribuzione di metilazione è paragone di campioni;
● Analisi di e Regioni Metilate Differenzialmente (DMR);
● Annotazione funzionale di i geni assuciati à i DMR.
Cuntrollu di qualità: efficienza di a digestione (in a mappatura di u genomu)
Cuntrollu di qualità: cunversione di bisulfitu (in l'estrazione di l'infurmazioni di metilazione)
Carta di metilazione: distribuzione di metilazione 5mC in tuttu u genomu
Paragone di campioni: Analisi di i cumpunenti principali
Analisi di e Regioni Metilate Differenzialmente (DMR): mappa di calore
Esplora i progressi di a ricerca facilitati da i servizii di sequenziamentu di bisulfiti di u genomu interu di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Li, Z. et al. (2022) 'Riprogrammazione à alta fedeltà in cellule di tipu Leydig per attivazione CRISPR è fattori paracrini',Nexus PNAS, 1 (4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Analisi di metilazione di u DNA à livellu di u genomu di a cumpusizione di u corpu in gemelli monozigoti chinesi',Rivista Europea di Investigazione Clinica, 53(11), p. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'Metilazione di u DNA è rapportu cintura-anca: un studiu d'associazione à livellu di l'epigenoma in gemelli monozigoti cinesi',Rivista di Investigazione Endocrinologica, 45 (12), pp. 2365-2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
