Sequenza di bisulfite à rappresentazione ridotta (RRBS)
Specificazioni di serviziu
Piattaforma: piattaforma NovaSeq, PE150
Tipu di libreria: 200-400bp inserisci libreria di DNA trattata con bisulfite
Strategia di sequenza: Paired-End 150 bp
Consiglia l'output di dati: 10 Gb di dati grezzi/campione
Requisiti di mostra
Quantità di DNA: ≥ 2 ug
Cuncentrazione di DNA: ≥ 20 ng/μl.
Purezza: OD260/280 = 1,8 à 2,0 senza degradazione o contaminazione da RNA
Analisi bioinformatica
Flussu di travagliu di serviziu
Consegna di mostra
Custruzzione di biblioteca
Sequencing
Analisi di dati
Servizi post-vendita
a.Statistiche di allineamentu di u genoma di riferimentu
Statistiche di lettura di carte
Statistics di a prufundità di sequenza è a cobertura di u situ C
Acopertura accumulata
Defficienza di igestioni di ogni mostra
b.Rilevazione di u situ di metilazione
Lista di i livelli di metilazione in u situ C
BS cunversione
Mcitosina etilata
Distribuzione di u nivellu di metilazione
c.Mappa di metilazione
Gin tutta l'enome
Gl'elementu enome
d.Comparazione di i livelli di metilazione trà i campioni
PAirwise Correlation di metilazione CG
Pmetilazione CA-CG
Clustre di metilazione CG
d.Analisi di metilazione differenziale
Sstatistiche di DMR
Distribuzione di lunghezza DMR
Hmanghja mappa
DDistribuzione MR in a regione mirata
