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BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
A trascriptomica spaziale si trova à l'avanguardia di l'innuvazione scientifica, chì permette à i circadori di sfondà in mudelli intricati di espressione genica in i tessuti mentre priservendu u so cuntestu spaziale. Tra diverse piattaforme, BMKGene hà sviluppatu u BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, chì vanta una risoluzione avanzata di 3,5 µm, ghjunghje à a gamma subcellulare, è chì permette impostazioni di risoluzione multi-livellu. U chip S3000, cun circa 4 milioni di spots, impiega microwells stratificati cù perle caricate cù sonde di cattura spaziali cù codice a barre. Una biblioteca di cDNA, arricchita cù codici à barre spaziali, hè preparata da u chip S3000 è dopu sequenziata nantu à a piattaforma Illumina NovaSeq. A cumminazzioni di campioni di codice à barre spaziale è UMI assicura l'accuratezza è a specificità di e dati generati. U chip BMKManu S3000 hè estremamente versatile, offre paràmetri di risoluzione multi-livellu chì ponu esse sintonizzati finamente à diversi tessuti è livelli desiderati di dettagliu. Questa adattabilità pone u chip cum'è una scelta eccezziunale per diversi studii di trascriptomica spaziale, assicurendu un clustering spaziale precisu cù u minimu rumore. L'usu di a tecnulugia di segmentazione cellulare cù BMKManu S3000 permette a delimitazione di e dati di trascrizzione à i cunfini di e cellule, risultatu in una analisi chì hà significatu biologicu direttu. Inoltre, a risoluzione migliorata di S3000 si traduce in un numeru più altu di geni è UMI rilevati per cellula, chì permette una analisi assai più precisa di i mudelli di trascrizione spaziale è clustering di cellule.
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Sequenza di RNA à un nucleu
U sviluppu di tecniche di cattura di una sola cellula è di custruzzione di biblioteche persunalizati, accumpagnate da a sequenza d'alta produzzione, hà rivoluzionatu i studii di l'espressione genica à u livellu di e cellule. Questa avanzata permette un'analisi più profonda è più cumpleta di e populazioni di cellule cumplesse, superendu e limitazioni assuciate à a media di l'espressione genica in tutte e cellule è priservendu a vera eterogeneità in queste populazioni. Mentre chì a sequenza di RNA unicellula (scRNA-seq) hà vantaghji innegabili, scontra sfide in certi tessuti induve a creazione di una sospensione unicellulare hè difficiule è richiede campioni freschi. In BMKGene, affrontemu stu ostaculu offrendu sequencing RNA unicu nucleu (snRNA-seq) utilizendu a tecnulugia di punta 10X Genomics Chromium. Stu approcciu allarga u spettru di campioni suscettibili à l'analisi di transcriptome à u livellu di una sola cellula.
L'isolamentu di i nuclei hè realizatu per mezu di u chip innovativu 10X Genomics Chromium, cun un sistema di microfluidica à ottu canali cù doppia traversata. Dentru stu sistema, perle di gel chì incorporanu codici a barre, primers, enzimi, è un unicu nucleu sò incapsulati in gocce d'oliu di nanolitru, furmendu Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Dopu a furmazione di GEM, a lisi cellulare è a liberazione di codice à barre si verificanu in ogni GEM. Successivamente, e molecule di mRNA sò sottoposti a trascrizione inversa in cDNA, incorporandu codici a barre 10X è Identificatori Moleculari Unici (UMI). Questi cDNA sò allora sottumessi à a custruzzione di libreria di sequenza standard, facilitendu una esplorazione robusta è cumpleta di i profili di espressione genica à u livellu unicellulare.
Piattaforma: 10× Genomics Chromium è Illumina NovaSeq Platform
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10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
A trascriptomica spaziale hè una tecnulugia d'avanguardia chì permette à i circadori di investigà i mudelli di espressione genica in i tessuti mentre priservendu u so cuntestu spaziale. Una piattaforma putente in questu duminiu hè 10x Genomics Visium accumpagnatu da a sequenza Illumina. U principiu di 10X Visium si trova nantu à un chip specializatu cù una zona di cattura designata induve e sezioni di tissuti sò posti. Questa zona di cattura cuntene spots di codice à barre, ognunu currisponde à un locu spaziale unicu in u tissutu. E molécule di RNA catturate da u tissutu sò allora marcate cù identificatori moleculari unichi (UMI) durante u prucessu di trascrizione inversa. Questi spots di codice à barre è UMI permettenu una cartografica spaziale precisa è a quantificazione di l'espressione genica à una risoluzione unicellulare. A cumminazzioni di campioni di codice à barre spaziale è UMI assicura l'accuratezza è a specificità di e dati generati. Utilizendu sta tecnulugia di Transcriptomica Spaziale, i circadori ponu acquistà una cunniscenza più profonda di l'urganizazione spaziale di e cellule è di l'interazzioni molecolari cumplessi chì si verificanu in i tessuti, offrendu insights inestimabili nantu à i meccanismi sottumessi à i prucessi biologichi in parechji campi, cumprese l'oncologia, a neuroscienza, a biologia di u sviluppu, l'immunologia. , è studii botanici.
Piattaforma: 10X Genomics Visium è Illumina NovaSeq
