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BMKMANU S3000_Trascrittoma Spaziale
A trascrittomica spaziale hè una tecnica chì ci permette di catturà è visualizà l'espressione genica in i tessuti. Questu pò esse cruciale per capisce cumu interagiscenu e cellule.
Ci sò diverse piattaforme per questu approcciu. À questu puntu, BMKGene hà sviluppatu u chip di trascrittomu spaziale BMKManu 3000, una piattaforma chì aumenta e prestazioni di a tecnica, righjunghjendu una risoluzione subcellulare è permettendu un paràmetru di risoluzione multilivello.
Stu chip cuntene 4,2 milioni di macchie aduprendu una tecnulugia brevettata di micropozzi stratificati cù perle caricate cù sonde cù codice à barre spaziale. Cù stu metudu, dopu a cattura è l'amplificazione, ottenemu una biblioteca di cDNA arricchita cù i campioni cù codice à barre chì hè cumpatibile cù Illumina.
Nantu à i dati, a cumbinazione di codici à barre spaziali è UMI garantisce a precisione è a specificità di i dati generati. Cumbinendu tuttu ciò chì hè statu dettu sopra, BMKManu furnisce un paràmetru di dati estremamente versatile.
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Sequenziamentu di RNA à nucleu unicu
U sviluppu di tecniche di cattura di cellule singole è di custruzzione di biblioteche persunalizate, accumpagnatu da u sequenziamentu à altu rendimentu, hà rivoluzionatu i studii di l'espressione genica à u livellu cellulare. Questa scuperta permette un'analisi più profonda è cumpleta di pupulazioni cellulari cumplesse, superendu i limiti assuciati à a media di l'espressione genica nantu à tutte e cellule è priservendu a vera eterogeneità in queste pupulazioni. Mentre u sequenziamentu di l'ARN di cellule singole (scRNA-seq) hà vantaghji innegabili, incontra sfide in certi tessuti induve a creazione di una sospensione di cellule singole si rivela difficiule è richiede campioni freschi. In BMKGene, affrontemu questu ostaculu offrendu u sequenziamentu di l'ARN di nucleu unicu (snRNA-seq) utilizendu a tecnulugia 10X Genomics Chromium di punta. Questu approcciu allargisce u spettru di campioni suscettibili di analisi di trascrittoma à u livellu di cellule singole.
L'isolamentu di i nuclei hè realizatu per mezu di l'innovativu chip 10X Genomics Chromium, chì presenta un sistema microfluidicu à ottu canali cù doppii incruciamenti. In questu sistema, e perle di gel chì incorporanu codici à barre, primer, enzimi è un unicu nucleu sò incapsulate in gocce d'oliu di a dimensione di nanolitri, furmendu Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Dopu a furmazione di GEM, a lisi cellulare è u rilasciu di codici à barre si verificanu in ogni GEM. Successivamente, e molecule di mRNA subiscenu una trascrizione inversa in cDNA, chì incorporanu codici à barre 10X è Identificatori Moleculari Unichi (UMI). Questi cDNA sò poi sottumessi à a custruzzione di una biblioteca di sequenziamentu standard, facilitendu una esplorazione robusta è cumpleta di i profili d'espressione genica à u livellu di una sola cellula.
Piattaforma: 10× Piattaforma Genomica di Cromu è Illumina NovaSeq
