CircRNA

Kreesfërmeg RNAen (circRNAen) sinn net-kodéierend RNAen, déi kreesfërmeg Strukturen bilden a verschidde Reguléierungsrollen hunn, dorënner d'Konkurrenz mat miRNA ëm Zilgenen a Proteinbindung. D'BMKCloud circRNA Pipeline ass fir d'Analyse vun rRNA-ofgebauten Bibliothéiken mat engem gutt annotéierten a qualitativ héichwäertege Referenzgenom entwéckelt. D'Analyse fänkt mat Liestrimmung a Qualitéitskontroll un, gefollegt vun der Liesausriichtung mam Referenzgenom an der Prognose vun neien circRNAen, gekoppelt mat der Identifikatioun vu bekannte circRNAen aus Datenbanken. Déi entspriechend miRNA-Ziler an circRNA-Hosts ginn duerno identifizéiert. D'Differenzialexpressionsanalyse weist differenziell expriméiert circRNAen op, an déi entspriechend Hosts ginn funktionell annotéiert fir beräichert biologesch Funktiounen ze extrahéieren.