Циркулярна РНК

Кільцеве РНК (circRNA) – це некодуюча РНК, яка утворює кільцеві структури та має численні регуляторні ролі, включаючи конкуренцію з мікроРНК за цільові гени та зв'язування з білками. Конвеєр circRNA BMKCloud розроблений для аналізу бібліотек зі збідненою кількістю рРНК з добре анотованим та високоякісним референсним геномом. Аналіз починається з обрізання прочитаних фрагментів та контролю якості, після чого проводиться вирівнювання прочитаних фрагментів з референсним геномом та прогнозування нових circRNA, що поєднується з ідентифікацією відомих circRNA з баз даних. Згодом ідентифікуються відповідні мішені мікроРНК та господарі circRNA. Аналіз диференціальної експресії виявляє диференціально експресовані circRNA, а відповідні господарі функціонально анотуються для вилучення збагачених біологічних функцій.