CircRNA

Cirkulārās RNS (cirRNS) ir nekodējošas RNS, kas veido cirkulāras struktūras un kurām ir vairākas regulējošas lomas, tostarp konkurēšana ar miRNS par mērķa gēniem un saistīšanos ar olbaltumvielām. BMKCloud cirRNS cauruļvads ir paredzēts rRNS noplicinātu bibliotēku analīzei ar labi anotētu un augstas kvalitātes atsauces genomu. Analīze sākas ar nolasīšanas apgriešanu un kvalitātes kontroli, kam seko nolasīšanas saskaņošana ar atsauces genomu un jaunu cirRNS prognozēšana, apvienojumā ar zināmu cirRNS identificēšanu no datubāzēm. Pēc tam tiek identificēti atbilstošie miRNS mērķi un cirRNS saimnieki. Diferenciālās ekspresijas analīze atklāj diferencēti ekspresētas cirRNS, un atbilstošie saimnieki tiek funkcionāli anotēti, lai iegūtu bagātinātas bioloģiskās funkcijas.