SirkRNA

Sirkulêre RNA's (sirkRNA's) is nie-koderende RNA's wat sirkelvormige strukture vorm en verskeie regulatoriese rolle het, insluitend die kompetisie met miRNA vir teikengene en proteïenbinding. Die BMKCloud sirkRNA-pyplyn is ontwerp vir die analise van rRNA-uitgeputte biblioteke met 'n goed geannoteerde en hoë kwaliteit verwysingsgenoom. Die analise begin met leesafsnyding en kwaliteitsbeheer, gevolg deur leesbelyning met die verwysingsgenoom en voorspelling van nuwe sirkRNA's, tesame met die identifisering van bekende sirkRNA's uit databasisse. Die ooreenstemmende miRNA-teikens en sirkRNA-gashere word vervolgens geïdentifiseer. Differensiële ekspressie-analise onthul differensieel uitgedrukte sirkRNA's, en die ooreenstemmende gashere word funksioneel geannoteer om verrykte biologiese funksies te onttrek.