CircRNA
Кальцавыя РНК (circRNA) — гэта некодируючыя РНК, якія ўтвараюць кальцавыя структуры і выконваюць некалькі рэгуляторных роляў, у тым ліку канкуруюць з міРНК за гены-мішэні і звязванне з бялкамі. Канвеер circRNA BMKCloud прызначаны для аналізу бібліятэк з дэфіцытам рРНК з добра анатаваным і якасным эталонным геномам. Аналіз пачынаецца з абрэзкі прачытаных фрагментаў і кантролю якасці, затым ідзе выраўноўванне прачытаных фрагментаў з эталонным геномам і прагназаванне новых circRNA, у спалучэнні з ідэнтыфікацыяй вядомых circRNA з баз дадзеных. Пасля гэтага ідэнтыфікуюцца адпаведныя міРНК-мішэні і гаспадары circRNA. Аналіз дыферэнцыяльнай экспрэсіі выяўляе дыферэнцыяльна экспрэсаваныя circRNA, і адпаведныя гаспадары функцыянальна анатаваны для вылучэння ўзбагачаных біялагічных функцый.
Біяінфарматыка