CircRNA

Kružne RNK (circRNA) su nekodirajuće RNK koje formiraju kružne strukture i imaju višestruke regulatorne uloge, uključujući konkurenciju s miRNA za ciljne gene i vezivanje proteina. BMKCloud circRNA cjevovod je dizajniran za analizu biblioteka osiromašenih rRNA s dobro označenim i visokokvalitetnim referentnim genomom. Analiza počinje skraćivanjem očitavanja i kontrolom kvalitete, nakon čega slijedi poravnanje očitavanja s referentnim genomom i predviđanje novih circRNA, zajedno s identifikacijom poznatih circRNA iz baza podataka. Odgovarajuće miRNA ciljeve i circRNA domaćine naknadno se identificiraju. Analiza diferencijalne ekspresije otkriva različito eksprimirane circRNA, a odgovarajući domaćini su funkcionalno označeni kako bi se izdvojile obogaćene biološke funkcije.