CircRNA

RNA sirkular (circRNA) adalah RNA non-pengkode yang membentuk struktur melingkar dan memiliki banyak peran pengaturan, termasuk bersaing dengan miRNA untuk gen target dan pengikatan protein. Pipeline circRNA BMKCloud dirancang untuk analisis pustaka yang telah dikurangi rRNA dengan genom referensi yang terannotasi dengan baik dan berkualitas tinggi. Analisis dimulai dengan pemangkasan bacaan dan kontrol kualitas, diikuti oleh penyelarasan bacaan ke genom referensi dan prediksi circRNA baru, yang digabungkan dengan identifikasi circRNA yang dikenal dari basis data. Target miRNA dan inang circRNA yang sesuai kemudian diidentifikasi. Analisis ekspresi diferensial mengungkapkan circRNA yang diekspresikan secara diferensial, dan inang yang sesuai dianotasi secara fungsional untuk mengekstrak fungsi biologis yang diperkaya.