CircRNA

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CircRNA

 

L'ARN circulari (circRNA) sò ARN non codificanti chì formanu strutture circulari è anu parechji roli regulatori, cumprese a cumpetizione cù i miRNA per i geni bersagliu è u ligame di proteine. A pipeline circRNA BMKCloud hè cuncipita per l'analisi di biblioteche impoverite di rRNA cù un genomu di riferimentu ben annotatu è di alta qualità. L'analisi principia cù u tagliu di lettura è u cuntrollu di qualità, seguitu da l'allineamentu di lettura à u genomu di riferimentu è a previsione di novi circRNA, accumpagnati da l'identificazione di circRNA cunnisciuti da e basi di dati. I miRNA bersagliu currispondenti è l'ospiti circRNA sò successivamente identificati. L'analisi di l'espressione differenziale rivela circRNA espressi in modu differenziale, è l'ospiti currispondenti sò annotati funziunalmente per estrarre funzioni biologiche arricchite.

 

Bioinformatica

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