CircRNA

Кръговите РНК (circRNAs) са некодиращи РНК, които образуват кръгови структури и имат множество регулаторни роли, включително конкуриране с miRNA за целеви гени и свързване с протеини. BMKCloud circRNA конвейерът е предназначен за анализ на библиотеки с намален брой rRNA с добре анотиран и висококачествен референтен геном. Анализът започва с подрязване на четенията и контрол на качеството, последвано от подравняване на четенията с референтния геном и предсказване на нови circRNAs, съчетано с идентифициране на известни circRNAs от бази данни. Впоследствие се идентифицират съответните miRNA мишени и circRNA гостоприемници. Диференциалният експресионен анализ разкрива диференциално експресирани circRNAs и съответните гостоприемници се функционално анотират, за да се извлекат обогатени биологични функции.