SirkoRNA

Ang mga Circular RNA (circRNA) ay mga non-coding RNA na bumubuo ng mga pabilog na istruktura at may maraming regulatory role, kabilang ang pakikipagkumpitensya sa miRNA para sa mga target gene at protein binding. Ang BMKCloud circRNA pipeline ay dinisenyo para sa pagsusuri ng mga rRNA depleted libraries na may mahusay na annotated at mataas na kalidad na reference genome. Ang pagsusuri ay nagsisimula sa read trimming at quality control, na sinusundan ng read alignment sa reference genome at prediksyon ng mga nobelang circRNA, kasama ang pagtukoy ng mga kilalang circRNA mula sa mga database. Ang mga kaukulang miRNA target at circRNA host ay kasunod na tinutukoy. Ang differential expression analysis ay nagpapakita ng mga circRNA na may magkakaibang express, at ang mga kaukulang host ay nilagyan ng functionally annotation upang makuha ang mga enriched biological function.