CircRNA
RNA מעגלי (circRNAs) הוא RNA לא מקודד היוצר מבנים מעגליים ובעל תפקידים רגולטוריים מרובים, כולל תחרות עם miRNA על גני מטרה וקשירת חלבונים. צינור circRNA של BMKCloud מיועד לניתוח של ספריות rRNA מדוללות עם גנום ייחוס איכותי ומסומן היטב. הניתוח מתחיל בחיתוך קריאות ובקרת איכות, ולאחר מכן יישור קריאות לגנום הייחוס וחיזוי circRNAs חדשים, בשילוב עם זיהוי של circRNAs ידועים ממאגרי מידע. לאחר מכן מזוהים מטרות ה-miRNA התואמות ומארחי ה-circRNA. ניתוח ביטוי דיפרנציאלי מגלה circRNAs המתבטאים באופן דיפרנציאלי, והמארחים התואמים עוברים הסבר פונקציונלי כדי לחלץ תפקודים ביולוגיים מועשרים.
ביואינפורמטיקה