CircRNA

Els ARN circulars (circRNA) són ARN no codificants que formen estructures circulars i tenen múltiples funcions reguladores, com ara competir amb els miRNA pels gens diana i la unió a proteïnes. El pipeline circRNA de BMKCloud està dissenyat per a l'anàlisi de biblioteques amb esgotament d'ARN ribosòmic amb un genoma de referència ben anotat i d'alta qualitat. L'anàlisi comença amb el retallament de lectura i el control de qualitat, seguit de l'alineació de lectura amb el genoma de referència i la predicció de nous circRNA, juntament amb la identificació de circRNA coneguts a partir de bases de dades. Posteriorment, s'identifiquen els miRNA diana i els hostes de circRNA corresponents. L'anàlisi d'expressió diferencial revela els circRNA expressats diferencialment, i els hostes corresponents s'anoten funcionalment per extreure'n funcions biològiques enriquides.