CircRNA

Rengasmaiset RNA:t (sirkkuRNA:t) ovat koodaamattomia RNA:ita, jotka muodostavat rengasmaisia ​​rakenteita ja joilla on useita säätelyrooleja, mukaan lukien kilpailu miRNA:n kanssa kohdegeeneistä ja proteiiniin sitoutumisesta. BMKCloud-ringRNA-prosessi on suunniteltu analysoimaan rRNA:sta tyhjennettyjä kirjastoja, joissa on hyvin annotoitu ja korkealaatuinen referenssigenomi. Analyysi alkaa lukemisen leikkaamisella ja laadunvalvonnalla, jota seuraa lukemisen kohdistaminen referenssigenomiin ja uusien sirkkuRNA:iden ennustaminen, yhdistettynä tunnettujen sirkkuRNA:iden tunnistamiseen tietokannoista. Vastaavat miRNA-kohteet ja sirkkuRNA-isännät tunnistetaan myöhemmin. Differentiaalinen ilmentymisanalyysi paljastaa eri tavoin ilmentyvät sirkkuRNA:t, ja vastaavat isännät annotoidaan toiminnallisesti rikastettujen biologisten toimintojen tunnistamiseksi.